High-resolution spatial normalization for microarrays containing embedded technical replicates

Por Yuan, Daniel S., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2006

A framework for oligonucleotide microarray preprocessing

Por Carvalho, Benilton S., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2010

Accounting for GC-content bias reduces systematic errors and batch effects in ChIP-seq data

Por Teng, Mingxiang, Irizarry, Rafael A.
Publicado no Genome Res (2017)

Model-Based Quality Assessment and Base-Calling for Second-Generation Sequencing Data

Por Bravo, Héctor Corrada, Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2010

Stochastic epigenetic variation as a driving force of development, evolutionary adaptation, and disease

Por Feinberg, Andrew P., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2009

A Gene Expression Barcode for Microarray Data

Por Zilliox, Michael J., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2007

Accounting for cellular heterogeneity is critical in epigenome-wide association studies

Por Jaffe, Andrew E, Irizarry, Rafael A
Publicado em 2014

quantro: a data-driven approach to guide the choice of an appropriate normalization method

Por Hicks, Stephanie C., Irizarry, Rafael A.
Publicado no Genome Biol (2015)

Consolidated strategy for the analysis of microarray spike-in data

Por McCall, Matthew N., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2008

Thawing Frozen Robust Multi-array Analysis (fRMA)

Por McCall, Matthew N, Irizarry, Rafael A
Publicado em 2011

Feature-level exploration of a published Affymetrix GeneChip control dataset

Por Irizarry, Rafael A, Cope, Leslie M, Wu, Zhijin
Publicado em 2006

Quantifying uncertainty in genotype calls

Por Carvalho, Benilton S., Louis, Thomas A., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2010

A species-generalized probabilistic model-based definition of CpG islands

Por Irizarry, Rafael A., Wu, Hao, Feinberg, Andrew P.
Publicado em 2009

Intensity normalization improves color calling in SOLiD sequencing

Por Wu, Hao, Irizarry, Rafael A., Bravo, Héctor Corrada
Publicado em 2010

Removing technical variability in RNA-seq data using conditional quantile normalization

Por Hansen, Kasper D., Irizarry, Rafael A., WU, Zhijin
Publicado em 2012

BSmooth: from whole genome bisulfite sequencing reads to differentially methylated regions

Por Hansen, Kasper D, Langmead, Benjamin, Irizarry, Rafael A
Publicado em 2012

Overcoming bias and systematic errors in next generation sequencing data

Por Taub, Margaret A, Corrada Bravo, Hector, Irizarry, Rafael A
Publicado em 2010

Modeling of RNA-seq fragment sequence bias reduces systematic errors in transcript abundance estimation

Por Love, Michael I., Hogenesch, John B., Irizarry, Rafael A.
Publicado no Nat Biotechnol (2016)

Frozen robust multiarray analysis (fRMA)

Por McCall, Matthew N., Bolstad, Benjamin M., Irizarry, Rafael A.
Publicado em 2010

Comparing genotyping algorithms for Illumina's Infinium whole-genome SNP BeadChips

Por Ritchie, Matthew E, Liu, Ruijie, Carvalho, Benilton S, Irizarry, Rafael A
Publicado em 2011