Filtering, FDR and power

por van Iterson, Maarten, Boer, Judith M, Menezes, Renée X
Publicado em 2010

Controlling bias and inflation in epigenome- and transcriptome-wide association studies using the empirical null distribution

por van Iterson, Maarten, van Zwet, Erik W., Heijmans, Bastiaan T.
Publicado no Genome Biol (2017)

Differentiation-Defective Human Induced Pluripotent Stem Cells Reveal Strengths and Limitations of the Teratoma Assay and In Vitro Pluripotency Assays

por Bouma, Marga J., van Iterson, Maarten, Janssen, Bart, Mummery, Christine L., Salvatori, Daniela C.F., Freund, Christian
Publicado no Stem Cell Reports (2017)

Integrated analysis of microRNA and mRNA expression: adding biological significance to microRNA target predictions

por van Iterson, Maarten, Bervoets, Sander, de Meijer, Emile J., Buermans, Henk P., ’t Hoen, Peter A. C., Menezes, Renée X., Boer, Judith M.
Publicado em 2013

Extensive localization of long noncoding RNAs to the cytosol and mono- and polyribosomal complexes

por van Heesch, Sebastiaan, van Iterson, Maarten, Jacobi, Jetse, Boymans, Sander, Essers, Paul B, de Bruijn, Ewart, Hao, Wensi, MacInnes, Alyson W, Cuppen, Edwin, Simonis, Marieke
Publicado em 2014

The Effects of Low Levels of Dystrophin on Mouse Muscle Function and Pathology

por van Putten, Maaike, Hulsker, Margriet, Nadarajah, Vishna Devi, van Heiningen, Sandra H., van Huizen, Ella, van Iterson, Maarten, Admiraal, Peter, Messemaker, Tobias, den Dunnen, Johan T., 't Hoen, Peter A. C., Aartsma-Rus, Annemieke
Publicado em 2012

A SNP panel for identification of DNA and RNA specimens

por Yousefi, Soheil, Abbassi-Daloii, Tooba, Kraaijenbrink, Thirsa, Vermaat, Martijn, Mei, Hailiang, van ‘t Hof, Peter, van Iterson, Maarten, Zhernakova, Daria V., Claringbould, Annique, Franke, Lude, ‘t Hart, Leen M., Slieker, Roderick C., van der Heijden, Amber, de Knijff, Peter, ’t Hoen, Peter A. C.
Publicado no BMC Genomics (2018)

DNA methylation signatures of educational attainment

por van Dongen, Jenny, Bonder, Marc Jan, Dekkers, Koen F., Nivard, Michel G., van Iterson, Maarten, Willemsen, Gonneke, Beekman, Marian, van der Spek, Ashley, van Meurs, Joyce B. J., Franke, Lude, Heijmans, Bastiaan T., van Duijn, Cornelia M., Slagboom, P. Eline, Boomsma, Dorret I.
Publicado no NPJ Sci Learn (2018)

Genetic and environmental influences interact with age and sex in shaping the human methylome

por van Dongen, Jenny, Nivard, Michel G., Willemsen, Gonneke, Hottenga, Jouke-Jan, Helmer, Quinta, Dolan, Conor V., Ehli, Erik A., Davies, Gareth E., van Iterson, Maarten, Breeze, Charles E., Beck, Stephan, Suchiman, H. Eka, Jansen, Rick, van Meurs, Joyce B., Heijmans, Bastiaan T., Slagboom, P. Eline, Boomsma, Dorret I.
Publicado no Nat Commun (2016)

Molecular dissection of germline chromothripsis in a developmental context using patient-derived iPS cells

por Middelkamp, Sjors, van Heesch, Sebastiaan, Braat, A. Koen, de Ligt, Joep, van Iterson, Maarten, Simonis, Marieke, van Roosmalen, Markus J., Kelder, Martijn J. E., Kruisselbrink, Evelien, Hochstenbach, Ron, Verbeek, Nienke E., Ippel, Elly F., Adolfs, Youri, Pasterkamp, R. Jeroen, Kloosterman, Wigard P., Kuijk, Ewart W., Cuppen, Edwin
Publicado no Genome Med (2017)

Genome-wide identification of genes regulating DNA methylation using genetic anchors for causal inference

por Hop, Paul J., Luijk, René, Daxinger, Lucia, van Iterson, Maarten, Dekkers, Koen F., Jansen, Rick, van Meurs, Joyce B. J., ’t Hoen, Peter A. C., Ikram, M. Arfan, van Greevenbroek, Marleen M. J., Boomsma, Dorret I., Slagboom, P. Eline, Veldink, Jan H., van Zwet, Erik W., Heijmans, Bastiaan T.
Publicado no Genome Biol (2020)

A characterization of cis- and trans-heritability of RNA-Seq-based gene expression

por Ouwens, Klaasjan G., Jansen, Rick, Nivard, Michel G., van Dongen, Jenny, Frieser, Maia J., Hottenga, Jouke-Jan, Arindrarto, Wibowo, Claringbould, Annique, van Iterson, Maarten, Mei, Hailiang, Franke, Lude, Heijmans, Bastiaan T., A. C. ’t Hoen, Peter, van Meurs, Joyce, Brooks, Andrew I., Penninx, Brenda W. J. H., Boomsma, Dorret I.
Publicado no Eur J Hum Genet (2019)

Genome-wide identification of directed gene networks using large-scale population genomics data

por Luijk, René, Dekkers, Koen F., van Iterson, Maarten, Arindrarto, Wibowo, Claringbould, Annique, Hop, Paul, Boomsma, Dorret I., van Duijn, Cornelia M., van Greevenbroek, Marleen M. J., Veldink, Jan H., Wijmenga, Cisca, Franke, Lude, ’t Hoen, Peter A. C., Jansen, Rick, van Meurs, Joyce, Mei, Hailiang, Slagboom, P. Eline, Heijmans, Bastiaan T., van Zwet, Erik W.
Publicado no Nat Commun (2018)

Age-related accrual of methylomic variability is linked to fundamental ageing mechanisms

por Slieker, Roderick C., van Iterson, Maarten, Luijk, René, Beekman, Marian, Zhernakova, Daria V., Moed, Matthijs H., Mei, Hailiang, van Galen, Michiel, Deelen, Patrick, Bonder, Marc Jan, Zhernakova, Alexandra, Uitterlinden, André G., Tigchelaar, Ettje F., Stehouwer, Coen D. A., Schalkwijk, Casper G., van der Kallen, Carla J. H., Hofman, Albert, van Heemst, Diana, de Geus, Eco J., van Dongen, Jenny, Deelen, Joris, van den Berg, Leonard H., van Meurs, Joyce, Jansen, Rick, ‘t Hoen, Peter A. C., Franke, Lude, Wijmenga, Cisca, Veldink, Jan H., Swertz, Morris A., van Greevenbroek, Marleen M. J., van Duijn, Cornelia M., Boomsma, Dorret I., Slagboom, P. Eline, Heijmans, Bastiaan T.
Publicado no Genome Biol (2016)

Genetically defined elevated homocysteine levels do not result in widespread changes of DNA methylation in leukocytes

por Mandaviya, Pooja R., Joehanes, Roby, Aïssi, Dylan, Kühnel, Brigitte, Marioni, Riccardo E., Truong, Vinh, Stolk, Lisette, Beekman, Marian, Bonder, Marc Jan, Franke, Lude, Gieger, Christian, Huan, Tianxiao, Ikram, M. Arfan, Kunze, Sonja, Liang, Liming, Lindemans, Jan, Liu, Chunyu, McRae, Allan F., Mendelson, Michael M., Müller-Nurasyid, Martina, Peters, Annette, Slagboom, P. Eline, Starr, John M., Trégouët, David-Alexandre, Uitterlinden, André G., van Greevenbroek, Marleen M. J., van Heemst, Diana, van Iterson, Maarten, Wells, Philip S., Yao, Chen, Deary, Ian J., Gagnon, France, Heijmans, Bastiaan T., Levy, Daniel, Morange, Pierre-Emmanuel, Waldenberger, Melanie, Heil, Sandra G., van Meurs, Joyce B. J.
Publicado no PLoS One (2017)

Blood lipids influence DNA methylation in circulating cells

por Dekkers, Koen F., van Iterson, Maarten, Slieker, Roderick C., Moed, Matthijs H., Bonder, Marc Jan, van Galen, Michiel, Mei, Hailiang, Zhernakova, Daria V., van den Berg, Leonard H., Deelen, Joris, van Dongen, Jenny, van Heemst, Diana, Hofman, Albert, Hottenga, Jouke J., van der Kallen, Carla J. H., Schalkwijk, Casper G., Stehouwer, Coen D. A., Tigchelaar, Ettje F., Uitterlinden, André G., Willemsen, Gonneke, Zhernakova, Alexandra, Franke, Lude, ’t Hoen, Peter A. C., Jansen, Rick, van Meurs, Joyce, Boomsma, Dorret I., van Duijn, Cornelia M., van Greevenbroek, Marleen M. J., Veldink, Jan H., Wijmenga, Cisca, van Zwet, Erik W., Slagboom, P. Eline, Jukema, J. Wouter, Heijmans, Bastiaan T.
Publicado no Genome Biol (2016)

Transcriptome and genome sequencing uncovers functional variation in humans

por Lappalainen, Tuuli, Sammeth, Michael, Friedländer, Marc R, ‘t Hoen, Peter AC, Monlong, Jean, Rivas, Manuel A, Gonzàlez-Porta, Mar, Kurbatova, Natalja, Griebel, Thasso, Ferreira, Pedro G, Barann, Matthias, Wieland, Thomas, Greger, Liliana, van Iterson, Maarten, Almlöf, Jonas, Ribeca, Paolo, Pulyakhina, Irina, Esser, Daniela, Giger, Thomas, Tikhonov, Andrew, Sultan, Marc, Bertier, Gabrielle, MacArthur, Daniel G, Lek, Monkol, Lizano, Esther, Buermans, Henk PJ, Padioleau, Ismael, Schwarzmayr, Thomas, Karlberg, Olof, Ongen, Halit, Kilpinen, Helena, Beltran, Sergi, Gut, Marta, Kahlem, Katja, Amstislavskiy, Vyacheslav, Stegle, Oliver, Pirinen, Matti, Montgomery, Stephen B, Donnelly, Peter, McCarthy, Mark I, Flicek, Paul, Strom, Tim M, Lehrach, Hans, Schreiber, Stefan, Sudbrak, Ralf, Carracedo, Ángel, Antonarakis, Stylianos E, Häsler, Robert, Syvänen, Ann-Christine, van Ommen, Gert-Jan, Brazma, Alvis, Meitinger, Thomas, Rosenstiel, Philip, Guigó, Roderic, Gut, Ivo G, Estivill, Xavier, Dermitzakis, Emmanouil T
Publicado em 2013