The C-terminal domain of DNA gyrase A adopts a DNA-bending β-pinwheel fold

Bằng Corbett, Kevin D., Shultzaberger, Ryan K., Berger, James M.
Được phát hành 2004

Dynamic profiling of mRNA turnover reveals gene-specific and system-wide regulation of mRNA decay

Bằng Munchel, Sarah E., Shultzaberger, Ryan K., Takizawa, Naoki, Weis, Karsten
Được phát hành 2011

Anatomy of Escherichia coli σ(70) promoters

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Chen, Zehua, Lewis, Karen A., Schneider, Thomas D.
Được phát hành 2007

The Fitness Landscapes of cis-Acting Binding Sites in Different Promoter and Environmental Contexts

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Malashock, Daniel S., Kirsch, Jack F., Eisen, Michael B.
Được phát hành 2010

Determining Physical Constraints in Transcriptional Initiation Complexes Using DNA Sequence Analysis

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Chiang, Derek Y., Moses, Alan M., Eisen, Michael B.
Được phát hành 2007

Probing the Informational and Regulatory Plasticity of a Transcription Factor DNA–Binding Domain

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Maerkl, Sebastian J., Kirsch, Jack F., Eisen, Michael B.
Được phát hành 2012

Single mutations in sasA enable a simpler ΔcikA gene network architecture with equivalent circadian properties

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Boyd, Joseph S., Katsuki, Takeo, Golden, Susan S., Greenspan, Ralph J.
Xuất bản năm Proc Natl Acad Sci U S A (2014)

Giving time purpose: The S. elongatus clock in a broader network context

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Boyd, Joseph S., Diamond, Spencer, Greenspan, Ralph J., Golden, Susan S.
Xuất bản năm Annu Rev Genet (2015)

High throughput and quantitative approaches for measuring circadian rhythms in cyanobacteria using bioluminescence

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Paddock, Mark L., Katsuki, Takeo, Greenspan, Ralph J., Golden, Susan S.
Xuất bản năm Methods Enzymol (2014)

Flexible promoter architecture requirements for coactivator recruitment

Bằng Chiang, Derek Y, Nix, David A, Shultzaberger, Ryan K, Gasch, Audrey P, Eisen, Michael B
Được phát hành 2006

Redox crisis underlies conditional light–dark lethality in cyanobacterial mutants that lack the circadian regulator, RpaA

Bằng Diamond, Spencer, Rubin, Benjamin E., Shultzaberger, Ryan K., Chen, You, Barber, Chase D., Golden, Susan S.
Xuất bản năm Proc Natl Acad Sci U S A (2017)

Agnostic detection of genomic alterations by holistic DNA structural interrogation

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Abrams, Rachel E., Sullivan, Challise J., Schmitt, Anthony D., Thompson, Thomas W. J., Dresios, John
Xuất bản năm PLoS One (2018)

Discovery of Fur binding site clusters in Escherichia coli by information theory models

Bằng Chen, Zehua, Lewis, Karen A., Shultzaberger, Ryan K., Lyakhov, Ilya G., Zheng, Ming, Doan, Bernard, Storz, Gisela, Schneider, Thomas D.
Được phát hành 2007

Correlation between binding rate constants and individual information of E. coli Fis binding sites

Bằng Shultzaberger, Ryan K., Roberts, Lindsey R., Lyakhov, Ilya G., Sidorov, Igor A., Stephen, Andrew G., Fisher, Robert J., Schneider, Thomas D.
Được phát hành 2007

The essential gene set of a photosynthetic organism

Bằng Rubin, Benjamin E., Wetmore, Kelly M., Price, Morgan N., Diamond, Spencer, Shultzaberger, Ryan K., Lowe, Laura C., Curtin, Genevieve, Arkin, Adam P., Deutschbauer, Adam, Golden, Susan S.
Xuất bản năm Proc Natl Acad Sci U S A (2015)