Structural Biology by NMR: Structure, Dynamics, and Interactions

Bằng Markwick, Phineus R. L., Malliavin, Thérèse, Nilges, Michael
Được phát hành 2008

Accurate Prediction of Amide Exchange in the Fast Limit Reveals Thrombin Allostery

Bằng Markwick, Phineus R.L., Peacock, Riley B., Komives, Elizabeth A.
Xuất bản năm Biophys J (2019)

Dynamic Consequences of Mutation of Tryptophan 215 in Thrombin

Bằng Peacock, Riley, Davis, Jessie, Markwick, Phineus R. L., Komives, Elizabeth A.
Xuất bản năm Biochemistry (2018)

On the Use of Accelerated Molecular Dynamics to Enhance Configurational Sampling in Ab Initio Simulations

Bằng Bucher, Denis, Pierce, Levi C. T., McCammon, J. Andrew, Markwick, Phineus R. L.
Được phát hành 2011

Adaptive Accelerated Molecular Dynamics (Ad-AMD) Revealing the Molecular Plasticity of P450cam

Bằng Markwick, Phineus R. L., Pierce, Levi C. T., Goodin, David B., McCammon, J. Andrew
Được phát hành 2011

Accelerating chemical reactions: Exploring reactive free-energy surfaces using accelerated ab initio molecular dynamics

Bằng Pierce, Levi C. T., Markwick, Phineus R. L., McCammon, J. Andrew, Doltsinis, Nikos L.
Được phát hành 2011

Enhanced Lipid Diffusion and Mixing in Accelerated Molecular Dynamics

Bằng Wang, Yi, Markwick, Phineus R. L., de Oliveira, César Augusto F., McCammon, J. Andrew
Được phát hành 2011

Toward a Unified Representation of Protein Structural Dynamics in Solution

Bằng Markwick, Phineus R. L., Bouvignies, Guillaume, Salmon, Loic, McCammon, J. Andrew, Nilges, Michael, Blackledge, Martin
Được phát hành 2009

Allosteric networks in thrombin distinguish procoagulant vs. anticoagulant activities

Bằng Gasper, Paul M., Fuglestad, Brian, Komives, Elizabeth A., Markwick, Phineus R. L., McCammon, J. Andrew
Được phát hành 2012

Correlated Motions and Residual Frustration in Thrombin

Bằng Fuglestad, Brian, Gasper, Paul M., McCammon, J. Andrew, Markwick, Phineus R. L., Komives, Elizabeth A.
Được phát hành 2013

Exploring the Photophysical Properties of Molecular Systems Using Excited State Accelerated ab Initio Molecular Dynamics

Bằng Ortiz-Sánchez, Juan Manuel, Bucher, Denis, Pierce, Levi C. T., Markwick, Phineus R. L., McCammon, J. Andrew
Được phát hành 2012

The Dynamic Structure of Thrombin in Solution

Bằng Fuglestad, Brian, Gasper, Paul M., Tonelli, Marco, McCammon, J. Andrew, Markwick, Phineus R.L., Komives, Elizabeth A.
Được phát hành 2012

Enhanced Conformational Space Sampling Improves the Prediction of Chemical Shifts in Proteins

Bằng Markwick, Phineus R. L., Cervantes, Carla F., Abel, Barrett L., Komives, Elizabeth A., Blackledge, Martin, McCammon, J. Andrew
Được phát hành 2010

Disease-Associated Mutations Disrupt Functionally Important Regions of Intrinsic Protein Disorder

Bằng Vacic, Vladimir, Markwick, Phineus R. L., Oldfield, Christopher J., Zhao, Xiaoyue, Haynes, Chad, Uversky, Vladimir N., Iakoucheva, Lilia M.
Được phát hành 2012

NMR reveals a dynamic allosteric pathway in thrombin

Bằng Handley, Lindsey D., Fuglestad, Brian, Stearns, Kyle, Tonelli, Marco, Fenwick, R. Bryn, Markwick, Phineus R. L., Komives, Elizabeth A.
Xuất bản năm Sci Rep (2017)

Functional Dynamics of the Folded Ankyrin Repeats of IκBα Revealed by Nuclear Magnetic Resonance

Bằng Cervantes, Carla F., Markwick, Phineus R. L., Sue, Shih-Che, McCammon, J. Andrew, Dyson, H. Jane, Komives, Elizabeth A.
Được phát hành 2009

Cobalt 1,3-Diisopropyl-1H-imidazol-2-ylidene Complexes: Synthesis, Solid-State Structures, and Quantum Chemistry Calculations

Bằng Vélez, Carmen L., Markwick, Phineus R. L., Holland, Ryan L., DiPasquale, Antonio G., Rheingold, Arnold L., O’Connor, Joseph M.
Được phát hành 2010

Mechanism of Glycan Receptor Recognition and Specificity Switch for Avian, Swine, and Human Adapted Influenza Virus Hemagglutinins: A Molecular Dynamics Perspective

Bằng Newhouse, E. Irene, Xu, Dong, Markwick, Phineus R. L., Amaro, Rommie E., Pao, Hsing C., Wu, Kevin J., Alam, Maqsudul, McCammon, J. Andrew, Li, Wilfred W.
Được phát hành 2009

Distinct Glycan Topology for Avian and Human Sialo-Pentasaccharide Receptor Analogues upon Binding Different Hemagglutinins: A Molecular Dynamics Perspective

Bằng Xu, Dong, Newhouse, E. Irene, Amaro, Rommie E., Pao, Hsing C., Cheng, Lily S., Markwick, Phineus R. L., McCammon, J. Andrew, Li, Wilfred W., Arzberger, Peter W.
Được phát hành 2009

Multi-Timescale Conformational Dynamics of the SH3 Domain of CD2-Associated Protein using NMR Spectroscopy and Accelerated Molecular Dynamics**

Bằng Salmon, Loïc, Pierce, Levi, Grimm, Alexander, Ortega Roldan, Jose-Luis, Mollica, Luca, Jensen, Malene Ringkjøbing, van Nuland, Nico, Markwick, Phineus R L, McCammon, J Andrew, Blackledge, Martin
Được phát hành 2012