Načítá se...

Accurate assembly of transcripts through phase-preserving graph decomposition

We introduce Scallop, an accurate reference-based transcript assembler that improves reconstruction of multi-exon and lowly expressed transcripts. Scallop preserves long-range phasing paths extracted from reads, while producing a parsimonious set of transcripts and minimizing coverage deviation. On...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Vydáno v:Nat Biotechnol
Hlavní autoři: Shao, Mingfu, Kingsford, Carl
Médium: Artigo
Jazyk:Inglês
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5722698/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29131147
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/nbt.4020
Tagy: Přidat tag
Žádné tagy, Buďte první, kdo otaguje tento záznam!