Scalable Genomics with R and Bioconductor

Bằng Lawrence, Michael, Morgan, Martin
Xuất bản năm Stat Sci (2014)

Explaining phenotypic selection on plant attractive characters: male function, gender balance or ecological context?

Bằng Ashman, Tia-Lynn, Morgan, Martin T.
Được phát hành 2004

The Bioconductor channel in F1000Research

Bằng Huber, Wolfgang, Carey, Vincent, Davis, Sean, Hansen, Kasper Daniel, Morgan, Martin
Xuất bản năm F1000Res (2016)

ShortRead: a bioconductor package for input, quality assessment and exploration of high-throughput sequence data

Bằng Morgan, Martin, Anders, Simon, Lawrence, Michael, Aboyoun, Patrick, Pagès, Hervé, Gentleman, Robert
Được phát hành 2009

VariantAnnotation: a Bioconductor package for exploration and annotation of genetic variants

Bằng Obenchain, Valerie, Lawrence, Michael, Carey, Vincent, Gogarten, Stephanie, Shannon, Paul, Morgan, Martin
Được phát hành 2014

Genomic Differences Between Estrogen Receptor (ER)-Positive and ER-Negative Human Breast Carcinoma Identified by Single Nucleotide Polymorphism Array Comparative Genome Hybridizati...

Bằng Fang, Min, Toher, Jessica, Morgan, Martin, Davison, Jerry, Tannenbaum, Susan, Claffey, Kevin
Xuất bản năm Cancer (2010)

Reliable Analysis of Clinical Tumor-Only Whole-Exome Sequencing Data

Bằng Oh, Sehyun, Geistlinger, Ludwig, Ramos, Marcel, Morgan, Martin, Waldron, Levi, Riester, Markus
Xuất bản năm JCO Clin Cancer Inform (2020)

BiocPkgTools: Toolkit for mining the Bioconductor package ecosystem

Bằng Su, Shian, Carey, Vincent J., Shepherd, Lori, Ritchie, Matthew, Morgan, Martin T., Davis, Sean
Xuất bản năm F1000Res (2019)

Recent Genetic Selection in the Ancestral Admixture of Puerto Ricans

Bằng Tang, Hua , Choudhry, Shweta , Mei, Rui , Morgan, Martin , Rodriguez-Cintron, William , Burchard, Esteban González , Risch, Neil J. 
Được phát hành 2007

Response to Price et al.

Bằng Tang, Hua, Choudhry, Shweta, Mei, Rui, Morgan, Martin, Rodriguez-Cintron, William, Burchard, Esteban Gonzalez, Risch, Neil J.
Được phát hành 2008

Software for Computing and Annotating Genomic Ranges

Bằng Lawrence, Michael, Huber, Wolfgang, Pagès, Hervé, Aboyoun, Patrick, Carlson, Marc, Gentleman, Robert, Morgan, Martin T., Carey, Vincent J.
Được phát hành 2013

Orchestrating a community-developed computational workshop and accompanying training materials

Bằng Davis, Sean, Ramos, Marcel, Shepherd, Lori, Turaga, Nitesh, Geistlinger, Ludwig, Morgan, Martin T., Haibe-Kains, Benjamin, Waldron, Levi
Xuất bản năm F1000Res (2018)

restfulSE: A semantically rich interface for cloud-scale genomics with Bioconductor

Bằng Gopaulakrishnan, Shweta, Pollack, Samuela, Stubbs, BJ, Pagès, Hervé, Readey, John, Davis, Sean, Waldron, Levi, Morgan, Martin, Carey, Vincent
Xuất bản năm F1000Res (2019)

Global Alliance for Genomics and Health Meets Bioconductor: Toward Reproducible and Agile Cancer Genomics at Cloud Scale

Bằng Carey, Vincent J., Ramos, Marcel, Stubbs, Benjamin J., Gopaulakrishnan, Shweta, Oh, Sehyun, Turaga, Nitesh, Waldron, Levi, Morgan, Martin
Xuất bản năm JCO Clin Cancer Inform (2020)

gwasurvivr: an R package for genome-wide survival analysis

Bằng Rizvi, Abbas A, Karaesmen, Ezgi, Morgan, Martin, Preus, Leah, Wang, Junke, Sovic, Michael, Hahn, Theresa, Sucheston-Campbell, Lara E
Xuất bản năm Bioinformatics (2018)

Metabolic Signatures of Bacterial Vaginosis

Bằng Srinivasan, Sujatha, Morgan, Martin T., Fiedler, Tina L., Djukovic, Danijel, Hoffman, Noah G., Raftery, Daniel, Marrazzo, Jeanne M., Fredricks, David N.
Xuất bản năm mBio (2015)

Tximeta: Reference sequence checksums for provenance identification in RNA-seq

Bằng Love, Michael I., Soneson, Charlotte, Hickey, Peter F., Johnson, Lisa K., Pierce, N. Tessa, Shepherd, Lori, Morgan, Martin, Patro, Rob
Xuất bản năm PLoS Comput Biol (2020)

MYC-driven tumorigenesis is inhibited by WRN syndrome gene deficiency

Bằng Moser, Russell, Toyoshima, Masafumi, Robinson, Kristin, Gurley, Kay E., Howie, Heather L., Davison, Jerry, Morgan, Martin, Kemp, Christopher J., Grandori, Carla
Được phát hành 2012

More Than Meets the Eye: Associations of Vaginal Bacteria with Gram Stain Morphotypes Using Molecular Phylogenetic Analysis

Bằng Srinivasan, Sujatha, Morgan, Martin T., Liu, Congzhou, Matsen, Frederick A., Hoffman, Noah G., Fiedler, Tina L., Agnew, Kathy J., Marrazzo, Jeanne M., Fredricks, David N.
Được phát hành 2013

Multiomic Integration of Public Oncology Databases in Bioconductor

Bằng Ramos, Marcel, Geistlinger, Ludwig, Oh, Sehyun, Schiffer, Lucas, Azhar, Rimsha, Kodali, Hanish, de Bruijn, Ino, Gao, Jianjiong, Carey, Vincent J., Morgan, Martin, Waldron, Levi
Xuất bản năm JCO Clin Cancer Inform (2020)