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Enhancer accessibility and CTCF occupancy underlie asymmetric TAD architecture and cell type specific genome topology

Cohesin and CTCF are master regulators of genome topology. How these ubiquitous proteins contribute to cell-type specific genome structure is poorly understood. Here, we explore quantitative aspects of topologically associated domains (TAD) between pluripotent embryonic stem cells (ESC) and lineage-...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Nat Commun
Hauptverfasser: Barrington, Christopher, Georgopoulou, Dimitra, Pezic, Dubravka, Varsally, Wazeer, Herrero, Javier, Hadjur, Suzana
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Nature Publishing Group UK 2019
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6606583/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31266948
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-10725-9
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