ToTem: a tool for variant calling pipeline optimization

BACKGROUND: High-throughput bioinformatics analyses of next generation sequencing (NGS) data often require challenging pipeline optimization. The key problem is choosing appropriate tools and selecting the best parameters for optimal precision and recall. RESULTS: Here we introduce ToTem, a tool for...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:BMC Bioinformatics
Main Authors: Tom, Nikola, Tom, Ondrej, Malcikova, Jitka, Pavlova, Sarka, Kubesova, Blanka, Rausch, Tobias, Kolarik, Miroslav, Benes, Vladimir, Bystry, Vojtech, Pospisilova, Sarka
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2018
Assuntos:
Software
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6020218/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29940847
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s12859-018-2227-x
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