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Quantitative DMS mapping for automated RNA secondary structure inference

For decades, dimethyl sulfate (DMS) mapping has informed manual modeling of RNA structure in vitro and in vivo. Here, we incorporate DMS data into automated secondary structure inference using an energy minimization framework developed for 2′-OH acylation (SHAPE) map-ping. On six non-coding RNAs wit...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Cordero, Pablo, Kladwang, Wipapat, VanLang, Christopher C., Das, Rhiju
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2012
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3448840/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22913637
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1021/bi3008802
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