Molecular Dynamics Simulations of Guanine Quadruplex Loops: Advances and Force Field Limitations

A computational analysis of d(GGGGTTTTGGGG)(2) guanine quadruplexes containing either lateral or diagonal four-thymidine loops was carried out using molecular dynamics (MD) simulations in explicit solvent, locally enhanced sampling (LES) simulations, systematic conformational search, and free energy...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autoři: Fadrná, Eva, Špačková, Nad'a, Štefl, Richard, Koča, Jaroslav, Cheatham, Thomas E., Šponer, Jiří
Médium: Artigo
Jazyk:Inglês
Vydáno: Biophysical Society 2004
Témata:
Biophysical Theory and Modeling
On-line přístup:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1304345/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15240460
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1529/biophysj.103.034751
Tagy: Přidat tag
Žádné tagy, Buďte první, kdo otaguje tento záznam!

Podobné jednotky