HLA predictions from the bronchoalveolar lavage fluid samples of five patients at the early stage of the wuhan seafood market COVID-19 outbreak

par Warren, René L., Birol, Inanç
Publié dans ArXiv (2020)

HLA predictions from the bronchoalveolar lavage fluid and blood samples of eight COVID-19 patients at the pandemic onset

par Warren, René L, Birol, Inanç
Publié dans Bioinformatics (2020)

Retrospective in silico HLA predictions from COVID-19 patients reveal alleles associated with disease prognosis

par Warren, René L., Birol, Inanç
Publié dans medRxiv (2020)

Interactive SARS-COV-2 mutation timemaps

par Warren, René L., Birol, Inanç
Publié dans ArXiv (2020)

Interactive SARS-CoV-2 mutation timemaps

par Warren, René L., Birol, Inanc
Publié dans F1000Res (2021)

Targeted Assembly of Short Sequence Reads

par Warren, René L., Holt, Robert A.
Publié 2011

Constructing large DNA segments by iterative clone recombination

par Smailus, Duane E., Warren, Rene L., Holt, Robert A.
Publié 2008

NanoSim: nanopore sequence read simulator based on statistical characterization

par Yang, Chen, Chu, Justin, Warren, René L, Birol, Inanç
Publié dans Gigascience (2017)

Innovations and challenges in detecting long read overlaps: an evaluation of the state-of-the-art

par Chu, Justin, Mohamadi, Hamid, Warren, René L, Yang, Chen, Birol, Inanç
Publié dans Bioinformatics (2017)

ARCS: scaffolding genome drafts with linked reads

par Yeo, Sarah, Coombe, Lauren, Warren, René L, Chu, Justin, Birol, Inanç
Publié dans Bioinformatics (2018)

ntJoin: Fast and lightweight assembly-guided scaffolding using minimizer graphs

par Coombe, Lauren, Nikolić, Vladimir, Chu, Justin, Birol, Inanc, Warren, René L
Publié dans Bioinformatics (2020)

Assembling millions of short DNA sequences using SSAKE

par Warren, René L., Sutton, Granger G., Jones, Steven J. M., Holt, Robert A.
Publié dans Bioinformatics (2007)

Kollector: transcript-informed, targeted de novo assembly of gene loci

par Kucuk, Erdi, Chu, Justin, Vandervalk, Benjamin P, Hammond, S Austin, Warren, René L, Birol, Inanc
Publié dans Bioinformatics (2017)

Kollector: transcript-informed, targeted de novo assembly of gene loci

par Kucuk, Erdi, Chu, Justin, Vandervalk, Benjamin P, Austin Hammond, S, Warren, René L, Birol, Inanc
Publié dans Bioinformatics (2017)

ChopStitch: exon annotation and splice graph construction using transcriptome assembly and whole genome sequencing data

par Khan, Hamza, Mohamadi, Hamid, Vandervalk, Benjamin P, Warren, Rene L, Chu, Justin, Birol, Inanc
Publié dans Bioinformatics (2018)

Trans-NanoSim characterizes and simulates nanopore RNA-sequencing data

par Hafezqorani, Saber, Yang, Chen, Lo, Theodora, Nip, Ka Ming, Warren, René L, Birol, Inanc
Publié dans Gigascience (2020)

Profiling the T-cell receptor beta-chain repertoire by massively parallel sequencing

par Freeman, J. Douglas, Warren, René L., Webb, John R., Nelson, Brad H., Holt, Robert A.
Publié 2009

Sealer: a scalable gap-closing application for finishing draft genomes

par Paulino, Daniel, Warren, René L., Vandervalk, Benjamin P., Raymond, Anthony, Jackman, Shaun D., Birol, Inanç
Publié dans BMC Bioinformatics (2015)

RNA-Bloom enables reference-free and reference-guided sequence assembly for single-cell transcriptomes

par Nip, Ka Ming, Chiu, Readman, Yang, Chen, Chu, Justin, Mohamadi, Hamid, Warren, René L., Birol, Inanc
Publié dans Genome Res (2020)

Transcription of foreign DNA in Escherichia coli

par Warren, René L., Freeman, John D., Levesque, Roger C., Smailus, Duane E., Flibotte, Stephane, Holt, Robert A.
Publié 2008