The Effects of Demography and Long-Term Selection on the Accuracy of Genomic Prediction with Sequence Data

Bằng MacLeod, Iona M., Hayes, Ben J., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Genetics (2014)

Genome-wide comparative analyses of correlated and uncorrelated phenotypes identify major pleiotropic variants in dairy cattle

Bằng Xiang, Ruidong, MacLeod, Iona M., Bolormaa, Sunduimijid, Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Sci Rep (2017)

Inferring Demography from Runs of Homozygosity in Whole-Genome Sequence, with Correction for Sequence Errors

Bằng MacLeod, Iona M., Larkin, Denis M., Lewin, Harris A., Hayes, Ben J., Goddard, Mike E.
Được phát hành 2013

Effect direction meta-analysis of GWAS identifies extreme, prevalent and shared pleiotropy in a large mammal

Bằng Xiang, Ruidong, van den Berg, Irene, MacLeod, Iona M., Daetwyler, Hans D., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Commun Biol (2020)

Putative enhancer sites in the bovine genome are enriched with variants affecting complex traits

Bằng Wang, Min, Hancock, Timothy P., MacLeod, Iona M., Pryce, Jennie E., Cocks, Benjamin G., Hayes, Benjamin J.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2017)

Evaluation of the accuracy of imputed sequence variant genotypes and their utility for causal variant detection in cattle

Bằng Pausch, Hubert, MacLeod, Iona M., Fries, Ruedi, Emmerling, Reiner, Bowman, Phil J., Daetwyler, Hans D., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2017)

Application of a Bayesian non-linear model hybrid scheme to sequence data for genomic prediction and QTL mapping

Bằng Wang, Tingting, Chen, Yi-Ping Phoebe, MacLeod, Iona M., Pryce, Jennie E., Goddard, Michael E., Hayes, Ben J.
Xuất bản năm BMC Genomics (2017)

Two-Variance-Component Model Improves Genetic Prediction in Family Datasets

Bằng Tucker, George, Loh, Po-Ru, MacLeod, Iona M., Hayes, Ben J., Goddard, Michael E., Berger, Bonnie, Price, Alkes L.
Xuất bản năm Am J Hum Genet (2015)

Multi-breed genomic prediction using Bayes R with sequence data and dropping variants with a small effect

Bằng van den Berg, Irene, Bowman, Phil J., MacLeod, Iona M., Hayes, Ben J., Wang, Tingting, Bolormaa, Sunduimijid, Goddard, Mike E.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2017)

Rare Variants in Transcript and Potential Regulatory Regions Explain a Small Percentage of the Missing Heritability of Complex Traits in Cattle

Bằng Gonzalez-Recio, Oscar, Daetwyler, Hans D., MacLeod, Iona M., Pryce, Jennie E., Bowman, Phil J., Hayes, Ben J., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm PLoS One (2015)

Genome-wide fine-mapping identifies pleiotropic and functional variants that predict many traits across global cattle populations

Bằng Xiang, Ruidong, MacLeod, Iona M., Daetwyler, Hans D., de Jong, Gerben, O’Connor, Erin, Schrooten, Chris, Chamberlain, Amanda J., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Nat Commun (2021)

A conditional multi-trait sequence GWAS discovers pleiotropic candidate genes and variants for sheep wool, skin wrinkle and breech cover traits

Bằng Bolormaa, Sunduimijid, Swan, Andrew A., Stothard, Paul, Khansefid, Majid, Moghaddar, Nasir, Duijvesteijn, Naomi, van der Werf, Julius H. J., Daetwyler, Hans D., MacLeod, Iona M.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2021)

Genomic prediction based on selected variants from imputed whole-genome sequence data in Australian sheep populations

Bằng Moghaddar, Nasir, Khansefid, Majid, van der Werf, Julius H. J., Bolormaa, Sunduimijid, Duijvesteijn, Naomi, Clark, Samuel A., Swan, Andrew A., Daetwyler, Hans D., MacLeod, Iona M.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2019)

Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping

Bằng Beynon, Sarah E., Slavov, Gancho T., Farré, Marta, Sunduimijid, Bolormaa, Waddams, Kate, Davies, Brian, Haresign, William, Kijas, James, MacLeod, Iona M., Newbold, C. Jamie, Davies, Lynfa, Larkin, Denis M.
Xuất bản năm BMC Genet (2015)

Fine-mapping sequence mutations with a major effect on oligosaccharide content in bovine milk

Bằng Liu, Zhiqian, Wang, Tingting, Pryce, Jennie E., MacLeod, Iona M., Hayes, Ben J., Chamberlain, Amanda J., Jagt, Christy Vander, Reich, Coralie M., Mason, Brett A., Rochfort, Simone, Cocks, Benjamin G.
Xuất bản năm Sci Rep (2019)

Improving Genomic Prediction of Crossbred and Purebred Dairy Cattle

Bằng Khansefid, Majid, Goddard, Michael E., Haile-Mariam, Mekonnen, Konstantinov, Kon V., Schrooten, Chris, de Jong, Gerben, Jewell, Erica G., O’Connor, Erin, Pryce, Jennie E., Daetwyler, Hans D., MacLeod, Iona M.
Xuất bản năm Front Genet (2020)

Accuracy of imputation to whole-genome sequence in sheep

Bằng Bolormaa, Sunduimijid, Chamberlain, Amanda J., Khansefid, Majid, Stothard, Paul, Swan, Andrew A., Mason, Brett, Prowse-Wilkins, Claire P., Duijvesteijn, Naomi, Moghaddar, Nasir, van der Werf, Julius H., Daetwyler, Hans D., MacLeod, Iona M.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2019)

Expression of mitochondrial protein genes encoded by nuclear and mitochondrial genomes correlate with energy metabolism in dairy cattle

Bằng Dorji, Jigme, Vander Jagt, Christy J., Garner, Josie B., Marett, Leah C., Mason, Brett A., Reich, Coralie M., Xiang, Ruidong, Clark, Emily L., Cocks, Benjamin G., Chamberlain, Amanda J., MacLeod, Iona M., Daetwyler, Hans D.
Xuất bản năm BMC Genomics (2020)

Expression quantitative trait loci in sheep liver and muscle contribute to variations in meat traits

Bằng Yuan, Zehu, Sunduimijid, Bolormaa, Xiang, Ruidong, Behrendt, Ralph, Knight, Matthew I., Mason, Brett A., Reich, Coralie M., Prowse-Wilkins, Claire, Vander Jagt, Christy J., Chamberlain, Amanda J., MacLeod, Iona M., Li, Fadi, Yue, Xiangpeng, Daetwyler, Hans D.
Xuất bản năm Genet Sel Evol (2021)

Quantifying the contribution of sequence variants with regulatory and evolutionary significance to 34 bovine complex traits

Bằng Xiang, Ruidong, van den Berg, Irene, MacLeod, Iona M., Hayes, Benjamin J., Prowse-Wilkins, Claire P., Wang, Min, Bolormaa, Sunduimijid, Liu, Zhiqian, Rochfort, Simone J., Reich, Coralie M., Mason, Brett A., Vander Jagt, Christy J., Daetwyler, Hans D., Lund, Mogens S., Chamberlain, Amanda J., Goddard, Michael E.
Xuất bản năm Proc Natl Acad Sci U S A (2019)