STRONG: metagenomics strain resolution on assembly graphs

We introduce STrain Resolution ON assembly Graphs (STRONG), which identifies strains de novo, from multiple metagenome samples. STRONG performs coassembly, and binning into metagenome assembled genomes (MAGs), and stores the coassembly graph prior to variant simplification. This enables the subgraph...

Szczegółowa specyfikacja

Zapisane w:
Opis bibliograficzny
Wydane w:Genome Biol
Główni autorzy: Quince, Christopher, Nurk, Sergey, Raguideau, Sebastien, James, Robert, Soyer, Orkun S., Summers, J. Kimberly, Limasset, Antoine, Eren, A. Murat, Chikhi, Rayan, Darling, Aaron E.
Format: Artigo
Język:Inglês
Wydane: BioMed Central 2021
Hasła przedmiotowe:
Method
Dostęp online:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8311964/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34311761
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-021-02419-7
Etykiety: Dodaj etykietę
Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!

Podobne zapisy