Protocol for using heterologous spike-ins to normalize for technical variation in chromatin immunoprecipitation

Quantifying differential genome occupancy by chromatin immunoprecipitation (ChIP) remains challenging due to variation in chromatin fragmentation, immunoprecipitation efficiencies, and intertube variability. In this protocol, we add heterologous spike-ins from Drosophila chromatin as an internal con...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:STAR Protoc
Hauptverfasser: Greulich, Franziska, Mechtidou, Aikaterini, Horn, Teresa, Uhlenhaut, Nina Henriette
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Elsevier 2021
Schlagworte:
Protocol
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8220248/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/34189474
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100609
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