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PhISCS: a combinatorial approach for subperfect tumor phylogeny reconstruction via integrative use of single-cell and bulk sequencing data

Available computational methods for tumor phylogeny inference via single-cell sequencing (SCS) data typically aim to identify the most likely perfect phylogeny tree satisfying the infinite sites assumption (ISA). However, the limitations of SCS technologies including frequent allele dropout and vari...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Res
Hauptverfasser: Malikic, Salem, Mehrabadi, Farid Rashidi, Ciccolella, Simone, Rahman, Md. Khaledur, Ricketts, Camir, Haghshenas, Ehsan, Seidman, Daniel, Hach, Faraz, Hajirasouliha, Iman, Sahinalp, S. Cenk
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Cold Spring Harbor Laboratory Press 2019
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6836735/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31628256
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1101/gr.234435.118
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