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metaSNV: A tool for metagenomic strain level analysis

We present metaSNV, a tool for single nucleotide variant (SNV) analysis in metagenomic samples, capable of comparing populations of thousands of bacterial and archaeal species. The tool uses as input nucleotide sequence alignments to reference genomes in standard SAM/BAM format, performs SNV calling...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:PLoS One
Main Authors: Costea, Paul Igor, Munch, Robin, Coelho, Luis Pedro, Paoli, Lucas, Sunagawa, Shinichi, Bork, Peer
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Public Library of Science 2017
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5533426/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28753663
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0182392
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