Загрузка...

Informed kmer selection for de novo transcriptome assembly

Motivation: De novo transcriptome assembly is an integral part for many RNA-seq workflows. Common applications include sequencing of non-model organisms, cancer or meta transcriptomes. Most de novo transcriptome assemblers use the de Bruijn graph (DBG) as the underlying data structure. The quality o...

Полное описание

Сохранить в:
Библиографические подробности
Опубликовано в: :Bioinformatics
Главные авторы: Durai, Dilip A., Schulz, Marcel H.
Формат: Artigo
Язык:Inglês
Опубликовано: Oxford University Press 2016
Предметы:
Online-ссылка:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4892416/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27153653
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw217
Метки: Добавить метку
Нет меток, Требуется 1-ая метка записи!