Acceleration of short and long DNA read mapping without loss of accuracy using suffix array

HPG Aligner applies suffix arrays for DNA read mapping. This implementation produces a highly sensitive and extremely fast mapping of DNA reads that scales up almost linearly with read length. The approach presented here is faster (over 20× for long reads) and more sensitive (over 98% in a wide rang...

Mô tả đầy đủ

Đã lưu trong:
Chi tiết về thư mục
Xuất bản năm:Bioinformatics
Những tác giả chính: Tárraga, Joaquín, Arnau, Vicente, Martínez, Héctor, Moreno, Raul, Cazorla, Diego, Salavert-Torres, José, Blanquer-Espert, Ignacio, Dopazo, Joaquín, Medina, Ignacio
Định dạng: Artigo
Ngôn ngữ:Inglês
Được phát hành: Oxford University Press 2014
Những chủ đề:
Applications Notes
Truy cập trực tuyến:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4816028/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25143289
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu553
Các nhãn: Thêm thẻ
Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự