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Functional normalization of 450k methylation array data improves replication in large cancer studies

We propose an extension to quantile normalization that removes unwanted technical variation using control probes. We adapt our algorithm, functional normalization, to the Illumina 450k methylation array and address the open problem of normalizing methylation data with global epigenetic changes, such...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Biol
Hauptverfasser: Fortin, Jean-Philippe, Labbe, Aurélie, Lemire, Mathieu, Zanke, Brent W, Hudson, Thomas J, Fertig, Elana J, Greenwood, Celia MT, Hansen, Kasper D
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: BioMed Central 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4283580/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25599564
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-014-0503-2
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