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Preprocessing, normalization and integration of the Illumina HumanMethylationEPIC array with minfi

SUMMARY: The minfi package is widely used for analyzing Illumina DNA methylation array data. Here we describe modifications to the minfi package required to support the HumanMethylationEPIC (‘EPIC’) array from Illumina. We discuss methods for the joint analysis and normalization of data from the Hum...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Main Authors: Fortin, Jean-Philippe, Triche, Timothy J., Hansen, Kasper D
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2017
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5408810/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28035024
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw691
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