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A probabilistic framework for aligning paired-end RNA-seq data

Motivation: The RNA-seq paired-end read (PER) protocol samples transcript fragments longer than the sequencing capability of today's technology by sequencing just the two ends of each fragment. Deep sampling of the transcriptome using the PER protocol presents the opportunity to reconstruct the...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: Hu, Yin, Wang, Kai, He, Xiaping, Chiang, Derek Y., Prins, Jan F., Liu, Jinze
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Oxford University Press 2010
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2916723/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20576625
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btq336
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