BIPSPI: a method for the prediction of partner-specific protein–protein interfaces

Por Sanchez-Garcia, Ruben, Sorzano, C O S, Carazo, J M, Segura, Joan
Publicado no Bioinformatics (2019)

3DBIONOTES v3.0: crossing molecular and structural biology data with genomic variations

Por Segura, Joan, Sanchez-Garcia, Ruben, Sorzano, C O S, Carazo, J M
Publicado no Bioinformatics (2019)

Particle alignment reliability in single particle electron cryomicroscopy: a general approach

Por Vargas, J., Otón, J., Marabini, R., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado no Sci Rep (2016)

A theoretical model for EM-ML reconstruction algorithms applied to rotating PET scanners

Por Iriarte, A, Sorzano, C O S, Carazo, J M, Rubio, J L, Marabini, R
Publicado em 2009

Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

Por Vargas, J., Melero, R., Gómez-Blanco, J., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado no Sci Rep (2017)

Volumetric restrictions in single particle 3DEM reconstruction

Por Sorzano, C.O.S., Velázquez-Muriel, J.A., Marabini, R., Herman, G.T., Carazo, J.M.
Publicado em 2008

Improvements on marker-free images alignment for electron tomography

Por Sorzano, C.O.S., de Isidro-Gómez, F., Fernández-Giménez, E., Herreros, D., Marco, S., Carazo, J.M., Messaoudi, C.
Publicado no J Struct Biol X (2020)

Spectral signal-to-noise ratio and resolution assessment of 3D reconstructions

Por Unser, M., Sorzano, C.O.S., Thévenaz, P, Jonić, S., El-Bez, C., De Carlo, S., Conway, J.F., Trus, B.L.
Publicado em 2004

Automatic particle selection from electron micrographs using machine learning techniques

Por Sorzano, C.O.S., Recarte, E., Alcorlo, M., Bilbao-Castro, J.R., San-Martín, C., Marabini, R., Carazo, J.M.
Publicado em 2009

3DBIONOTES v2.0: a web server for the automatic annotation of macromolecular structures

Por Segura, Joan, Sanchez-Garcia, Ruben, Martinez, Marta, Cuenca-Alba, Jesus, Tabas-Madrid, Daniel, Sorzano, C O S, Carazo, J M
Publicado no Bioinformatics (2017)

3DEM Loupe: analysis of macromolecular dynamics using structures from electron microscopy

Por Nogales-Cadenas, R., Jonic, S., Tama, F., Arteni, A. A., Tabas-Madrid, D., Vázquez, M., Pascual-Montano, A., Sorzano, C. O. S.
Publicado em 2013

A clustering approach to multireference alignment of single-particle projections in electron microscopy

Por Sorzano, C.O.S., Bilbao-Castro, J.R., Shkolnisky, Y., Alcorlo, M., Melero, R., Caffarena-Fernández, G., Li, M., Xu, G., Marabini, R., Carazo, J.M.
Publicado em 2010

Measurement of local resolution in electron tomography

Por Vilas, J.L., Oton, J., Messaoudi, C., Melero, R., Conesa, P., Ramirez-Aportela, E., Mota, J., Martinez, M., Jimenez, A., Marabini, R., Carazo, J.M., Vargas, J., Sorzano, C.O.S.
Publicado no J Struct Biol X (2019)

Cryo-EM and the elucidation of new macromolecular structures: Random Conical Tilt revisited

Por Sorzano, C. O. S., Alcorlo, M., de la Rosa-Trevín, J. M., Melero, R., Foche, I., Zaldívar-Peraza, A., del Cano, L., Vargas, J., Abrishami, V., Otón, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado no Sci Rep (2015)

A Survey of the Use of Iterative Reconstruction Algorithms in Electron Microscopy

Por Sorzano, C. O. S., Vargas, J., Otón, J., de la Rosa-Trevín, J. M., Vilas, J. L., Kazemi, M., Melero, R., del Caño, L., Cuenca, J., Conesa, P., Gómez-Blanco, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado no Biomed Res Int (2017)

Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion

Por Maluenda, D., Majtner, T., Horvath, P., Vilas, J. L., Jiménez-Moreno, A., Mota, J., Ramírez-Aportela, E., Sánchez-García, R., Conesa, P., del Caño, L., Rancel, Y., Fonseca, Y., Martínez, M., Sharov, G., García, C.A., Strelak, D., Melero, R., Marabini, R., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publicado no Acta Crystallogr D Struct Biol (2019)

Survey of the analysis of continuous conformational variability of biological macromolecules by electron microscopy

Por Sorzano, C. O. S., Jiménez, A., Mota, J., Vilas, J. L., Maluenda, D., Martínez, M., Ramírez-Aportela, E., Majtner, T., Segura, J., Sánchez-García, R., Rancel, Y., del Caño, L., Conesa, P., Melero, R., Jonic, S., Vargas, J., Cazals, F., Freyberg, Z., Krieger, J., Bahar, I., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publicado no Acta Crystallogr F Struct Biol Commun (2019)

Using Scipion for stream image processing at Cryo-EM facilities

Por Gómez-Blanco, J., de la Rosa-Trevín, J.M., Marabini, R., del Cano, L., Jiménez, A., Martínez, M., Melero, R., Majtner, T., Maluenda, D., Mota, J., Rancel, Y., Ramírez-Aportela, E, Vilas, J.L., Carroni, M., Fleischmann, S., Lindahl, E., Ashton, A.W., Basham, M., Clare, D.K., Savage, K., Siebert, C.A., Sharov, G.G., Sorzano, C.O.S., Conesa, P., Carazo, J.M.
Publicado no J Struct Biol (2018)

ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation

Por de la Morena, J. Jimenez, Conesa, P., Fonseca, Y.C., de Isidro-Gómez, F.P., Herreros, D., Fernández-Giménez, E., Strelaka, D., Moebel, E., Buchholz, T.O., Jug, F., Martinez-Sanchez, A., Harastani, M., Jonic, S., Conesa, J.J., Cuervo, A., Losana, P., Sánchez, I., Iceta, M., del Cano, L., Gragera, M., Melero, R., Sharov, G., Castaño-Díez, D., Koster, A., Piccirillo, J.G., Vilas, J.L., Otón, J., Marabini, R., Sorzano, C.O.S., Carazo, J.M.
Publicado no J Struct Biol (2022)