Quantitative analysis of 3D alignment quality: its impact on soft-validation, particle pruning and homogeneity analysis

par Vargas, J., Melero, R., Gómez-Blanco, J., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publié dans Sci Rep (2017)

A clustering approach to multireference alignment of single-particle projections in electron microscopy

par Sorzano, C.O.S., Bilbao-Castro, J.R., Shkolnisky, Y., Alcorlo, M., Melero, R., Caffarena-Fernández, G., Li, M., Xu, G., Marabini, R., Carazo, J.M.
Publié 2010

Measurement of local resolution in electron tomography

par Vilas, J.L., Oton, J., Messaoudi, C., Melero, R., Conesa, P., Ramirez-Aportela, E., Mota, J., Martinez, M., Jimenez, A., Marabini, R., Carazo, J.M., Vargas, J., Sorzano, C.O.S.
Publié dans J Struct Biol X (2019)

Cryo-EM and the elucidation of new macromolecular structures: Random Conical Tilt revisited

par Sorzano, C. O. S., Alcorlo, M., de la Rosa-Trevín, J. M., Melero, R., Foche, I., Zaldívar-Peraza, A., del Cano, L., Vargas, J., Abrishami, V., Otón, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publié dans Sci Rep (2015)

A Survey of the Use of Iterative Reconstruction Algorithms in Electron Microscopy

par Sorzano, C. O. S., Vargas, J., Otón, J., de la Rosa-Trevín, J. M., Vilas, J. L., Kazemi, M., Melero, R., del Caño, L., Cuenca, J., Conesa, P., Gómez-Blanco, J., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publié dans Biomed Res Int (2017)

Flexible workflows for on-the-fly electron-microscopy single-particle image processing using Scipion

par Maluenda, D., Majtner, T., Horvath, P., Vilas, J. L., Jiménez-Moreno, A., Mota, J., Ramírez-Aportela, E., Sánchez-García, R., Conesa, P., del Caño, L., Rancel, Y., Fonseca, Y., Martínez, M., Sharov, G., García, C.A., Strelak, D., Melero, R., Marabini, R., Carazo, J. M., Sorzano, C. O. S.
Publié dans Acta Crystallogr D Struct Biol (2019)

Survey of the analysis of continuous conformational variability of biological macromolecules by electron microscopy

par Sorzano, C. O. S., Jiménez, A., Mota, J., Vilas, J. L., Maluenda, D., Martínez, M., Ramírez-Aportela, E., Majtner, T., Segura, J., Sánchez-García, R., Rancel, Y., del Caño, L., Conesa, P., Melero, R., Jonic, S., Vargas, J., Cazals, F., Freyberg, Z., Krieger, J., Bahar, I., Marabini, R., Carazo, J. M.
Publié dans Acta Crystallogr F Struct Biol Commun (2019)

Using Scipion for stream image processing at Cryo-EM facilities

par Gómez-Blanco, J., de la Rosa-Trevín, J.M., Marabini, R., del Cano, L., Jiménez, A., Martínez, M., Melero, R., Majtner, T., Maluenda, D., Mota, J., Rancel, Y., Ramírez-Aportela, E, Vilas, J.L., Carroni, M., Fleischmann, S., Lindahl, E., Ashton, A.W., Basham, M., Clare, D.K., Savage, K., Siebert, C.A., Sharov, G.G., Sorzano, C.O.S., Conesa, P., Carazo, J.M.
Publié dans J Struct Biol (2018)

ScipionTomo: Towards cryo-electron tomography software integration, reproducibility, and validation

par de la Morena, J. Jimenez, Conesa, P., Fonseca, Y.C., de Isidro-Gómez, F.P., Herreros, D., Fernández-Giménez, E., Strelaka, D., Moebel, E., Buchholz, T.O., Jug, F., Martinez-Sanchez, A., Harastani, M., Jonic, S., Conesa, J.J., Cuervo, A., Losana, P., Sánchez, I., Iceta, M., del Cano, L., Gragera, M., Melero, R., Sharov, G., Castaño-Díez, D., Koster, A., Piccirillo, J.G., Vilas, J.L., Otón, J., Marabini, R., Sorzano, C.O.S., Carazo, J.M.
Publié dans J Struct Biol (2022)