NIPTeR: an R package for fast and accurate trisomy prediction in non-invasive prenatal testing

door Johansson, Lennart F., de Weerd, Hendrik A., de Boer, Eddy N., van Dijk, Freerk, te Meerman, Gerard J., Sijmons, Rolf H., Sikkema-Raddatz, Birgit, Swertz, Morris A.
Gepubliceerd in BMC Bioinformatics (2018)

Split hand/foot malformation due to chromosome 7q aberrations(SHFM1): additional support for functional haploinsufficiency as the causative mechanism

door van Silfhout, Anneke T, van den Akker, Peter C, Dijkhuizen, Trijnie, Verheij, Joke B G M, Olderode-Berends, Maran J W, Kok, Klaas, Sikkema-Raddatz, Birgit, van Ravenswaaij-Arts, Conny M A
Gepubliceerd in 2009

Identification of ANKRD11 and ZNF778 as candidate genes for autism and variable cognitive impairment in the novel 16q24.3 microdeletion syndrome

door Willemsen, Marjolein H, Fernandez, Bridget A, Bacino, Carlos A, Gerkes, Erica, de Brouwer, Arjan PM, Pfundt, Rolph, Sikkema-Raddatz, Birgit, Scherer, Stephen W, Marshall, Christian R, Potocki, Lorraine, van Bokhoven, Hans, Kleefstra, Tjitske
Gepubliceerd in 2010

Balanced into array: genome-wide array analysis in 54 patients with an apparently balanced de novo chromosome rearrangement and a meta-analysis

door Feenstra, Ilse, Hanemaaijer, Nicolien, Sikkema-Raddatz, Birgit, Yntema, Helger, Dijkhuizen, Trijnie, Lugtenberg, Dorien, Verheij, Joke, Green, Andrew, Hordijk, Roel, Reardon, William, Vries, Bert de, Brunner, Han, Bongers, Ernie, Leeuw, Nicole de, van Ravenswaaij-Arts, Conny
Gepubliceerd in 2011

Strategies in Rapid Genetic Diagnostics of Critically Ill Children: Experiences From a Dutch University Hospital

door Imafidon, Miriam E., Sikkema-Raddatz, Birgit, Abbott, Kristin M., Meems-Veldhuis, Martine T., Swertz, Morris A., van der Velde, K. Joeri, Beunders, Gea, Bos, Dennis K., Knoers, Nine V. A. M., Kerstjens-Frederikse, Wilhelmina S., van Diemen, Cleo C.
Gepubliceerd in Front Pediatr (2021)

NIPTRIC: an online tool for clinical interpretation of non-invasive prenatal testing (NIPT) results

door Sikkema-Raddatz, Birgit, Johansson, Lennart F., de Boer, Eddy N., Boon, Elles M. J., Suijkerbuijk, Ron F., Bouman, Katelijne, Bilardo, Catia M., Swertz, Morris A., Dijkstra, Martijn, van Langen, Irene M., Sinke, Richard J., te Meerman, Gerard J.
Gepubliceerd in Sci Rep (2016)

GAVIN: Gene-Aware Variant INterpretation for medical sequencing

door van der Velde, K. Joeri, de Boer, Eddy N., van Diemen, Cleo C., Sikkema-Raddatz, Birgit, Abbott, Kristin M., Knopperts, Alain, Franke, Lude, Sijmons, Rolf H., de Koning, Tom J., Wijmenga, Cisca, Sinke, Richard J., Swertz, Morris A.
Gepubliceerd in Genome Biol (2017)

Practical guidelines for interpreting copy number gains detected by high-resolution array in routine diagnostics

door Hanemaaijer, Nicolien M, Sikkema-Raddatz, Birgit, van der Vries, Gerben, Dijkhuizen, Trijnie, Hordijk, Roel, van Essen, Anthonie J, Veenstra-Knol, Hermine E, Kerstjens-Frederikse, Wilhelmina S, Herkert, Johanna C, Gerkes, Erica H, Leegte, Lamberta K, Kok, Klaas, Sinke, Richard J, van Ravenswaaij-Arts, Conny M A
Gepubliceerd in 2012

TBX4 mutations (small patella syndrome) are associated with childhood-onset pulmonary arterial hypertension

door Kerstjens-Frederikse, Wilhelmina S, Bongers, Ernie M H F, Roofthooft, Marcus T R, Leter, Edward M, Douwes, J Menno, Van Dijk, Arie, Vonk-Noordegraaf, Anton, Dijk-Bos, Krista K, Hoefsloot, Lies H, Hoendermis, Elke S, Gille, Johan J P, Sikkema-Raddatz, Birgit, Hofstra, Robert M W, Berger, Rolf M F
Gepubliceerd in 2013

CAPICE: a computational method for Consequence-Agnostic Pathogenicity Interpretation of Clinical Exome variations

door Li, Shuang, van der Velde, K. Joeri, de Ridder, Dick, van Dijk, Aalt D. J., Soudis, Dimitrios, Zwerwer, Leslie R., Deelen, Patrick, Hendriksen, Dennis, Charbon, Bart, van Gijn, Marielle E., Abbott, Kristin, Sikkema-Raddatz, Birgit, van Diemen, Cleo C., Kerstjens-Frederikse, Wilhelmina S., Sinke, Richard J., Swertz, Morris A.
Gepubliceerd in Genome Med (2020)

A prospective study on rapid exome sequencing as a diagnostic test for multiple congenital anomalies on fetal ultrasound

door Corsten‐Janssen, Nicole, Bouman, Katelijne, Diphoorn, Janouk C. D., Scheper, Arjen J., Kinds, Rianne, el Mecky, Julia, Breet, Hanna, Verheij, Joke B. G. M., Suijkerbuijk, Ron, Duin, Leonie K., Manten, Gwendolyn T. R., van Langen, Irene M., Sijmons, Rolf H., Sikkema‐Raddatz, Birgit, Westers, Helga, van Diemen, Cleo C.
Gepubliceerd in Prenat Diagn (2020)

Under-reported aspects of diagnosis and treatment addressed in the Dutch-Flemish guideline for comprehensive diagnostics in disorders/differences of sex development

door van Bever, Yolande, Brüggenwirth, Hennie T, Wolffenbuttel, Katja P, Dessens, Arianne B, Groenenberg, Irene A L, Knapen, Maarten F C M, De Baere, Elfride, Cools, Martine, van Ravenswaaij-Arts, Conny M A, Sikkema-Raddatz, Birgit, Claahsen-van der Grinten, Hedi, Kempers, Marlies, Rinne, Tuula, Hersmus, Remko, Looijenga, Leendert, Hannema, Sabine E
Gepubliceerd in J Med Genet (2020)

Parental insertional balanced translocations are an important cause of apparently de novo CNVs in patients with developmental anomalies

door Nowakowska, Beata A, de Leeuw, Nicole, Ruivenkamp, Claudia AL, Sikkema-Raddatz, Birgit, Crolla, John A, Thoelen, Reinhilde, Koopmans, Marije, den Hollander, Nicolette, van Haeringen, Arie, van der Kevie-Kersemaekers, Anne-Marie, Pfundt, Rolph, Mieloo, Hanneke, van Essen, Ton, de Vries, Bert B A, Green, Andrew, Reardon, Willie, Fryns, Jean-Pierre, Vermeesch, Joris R
Gepubliceerd in 2012

Whole-exome sequencing is a powerful approach for establishing the etiological diagnosis in patients with intellectual disability and microcephaly

door Rump, Patrick, Jazayeri, Omid, van Dijk-Bos, Krista K., Johansson, Lennart F., van Essen, Anthonie J., Verheij, Johanna B. G. M., Veenstra-Knol, Hermine E., Redeker, Egbert J. W., Mannens, Marcel M. A. M., Swertz, Morris A., Alizadeh, Behrooz Z., van Ravenswaaij-Arts, Conny M. A., Sinke, Richard J., Sikkema-Raddatz, Birgit
Gepubliceerd in BMC Med Genomics (2016)

Improving the diagnostic yield of exome- sequencing by predicting gene–phenotype associations using large-scale gene expression analysis

door Deelen, Patrick, van Dam, Sipko, Herkert, Johanna C., Karjalainen, Juha M., Brugge, Harm, Abbott, Kristin M., van Diemen, Cleo C., van der Zwaag, Paul A., Gerkes, Erica H., Zonneveld-Huijssoon, Evelien, Boer-Bergsma, Jelkje J., Folkertsma, Pytrik, Gillett, Tessa, van der Velde, K. Joeri, Kanninga, Roan, van den Akker, Peter C., Jan, Sabrina Z., Hoorntje, Edgar T., te Rijdt, Wouter P., Vos, Yvonne J., Jongbloed, Jan D. H., van Ravenswaaij-Arts, Conny M. A., Sinke, Richard, Sikkema-Raddatz, Birgit, Kerstjens-Frederikse, Wilhelmina S., Swertz, Morris A., Franke, Lude
Gepubliceerd in Nat Commun (2019)

TRIDENT-2: National Implementation of Genome-wide Non-invasive Prenatal Testing as a First-Tier Screening Test in the Netherlands

door van der Meij, Karuna R.M., Sistermans, Erik A., Macville, Merryn V.E., Stevens, Servi J.C., Bax, Caroline J., Bekker, Mireille N., Bilardo, Caterina M., Boon, Elles M.J., Boter, Marjan, Diderich, Karin E.M., de Die-Smulders, Christine E.M., Duin, Leonie K., Faas, Brigitte H.W., Feenstra, Ilse, Haak, Monique C., Hoffer, Mariëtte J.V., den Hollander, Nicolette S., Hollink, Iris H.I.M., Jehee, Fernanda S., Knapen, Maarten F.C.M., Kooper, Angelique J.A., van Langen, Irene M., Lichtenbelt, Klaske D., Linskens, Ingeborg H., van Maarle, Merel C., Oepkes, Dick, Pieters, Mijntje J., Schuring-Blom, G. Heleen, Sikkel, Esther, Sikkema-Raddatz, Birgit, Smeets, Dominique F.C.M., Srebniak, Malgorzata I., Suijkerbuijk, Ron F., Tan-Sindhunata, Gita M., van der Ven, A. Jeanine E.M., van Zelderen-Bhola, Shama L., Henneman, Lidewij, Galjaard, Robert-Jan H., Van Opstal, Diane, Weiss, Marjan M.
Gepubliceerd in Am J Hum Genet (2019)