Reverse Engineering Cancer: Inferring Transcriptional Gene Signatures from Copy Number Aberrations with ICAro

di Angeli, Davide, Fanciulli, Maurizio, Pallocca, Matteo
Pubblicato in Cancers (Basel) (2019)

The perfect personalized cancer therapy: cancer vaccines against neoantigens

di Aurisicchio, Luigi, Pallocca, Matteo, Ciliberto, Gennaro, Palombo, Fabio
Pubblicato in J Exp Clin Cancer Res (2018)

PTEN as a Prognostic/Predictive Biomarker in Cancer: An Unfulfilled Promise?

di Bazzichetto, Chiara, Conciatori, Fabiana, Pallocca, Matteo, Falcone, Italia, Fanciulli, Maurizio, Cognetti, Francesco, Milella, Michele, Ciuffreda, Ludovica
Pubblicato in Cancers (Basel) (2019)

Design of a companion bioinformatic tool to detect the emergence and geographical distribution of SARS-CoV-2 Spike protein genetic variants

di Massacci, Alice, Sperandio, Eleonora, D’Ambrosio, Lorenzo, Maffei, Mariano, Palombo, Fabio, Aurisicchio, Luigi, Ciliberto, Gennaro, Pallocca, Matteo
Pubblicato in J Transl Med (2020)

Long Non-coding MIR205HG Depletes Hsa-miR-590-3p Leading to Unrestrained Proliferation in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma

di Di Agostino, Silvia, Valenti, Fabio, Sacconi, Andrea, Fontemaggi, Giulia, Pallocca, Matteo, Pulito, Claudio, Ganci, Federica, Muti, Paola, Strano, Sabrina, Blandino, Giovanni
Pubblicato in Theranostics (2018)

WEP: a high-performance analysis pipeline for whole-exome data

di D'Antonio, Mattia, D'Onorio De Meo, Paolo, Paoletti, Daniele, Elmi, Berardino, Pallocca, Matteo, Sanna, Nico, Picardi, Ernesto, Pesole, Graziano, Castrignanò, Tiziana
Pubblicazione 2013

RAP: RNA-Seq Analysis Pipeline, a new cloud-based NGS web application

di D'Antonio, Mattia, D'Onorio De Meo, Paolo, Pallocca, Matteo, Picardi, Ernesto, D'Erchia, Anna Maria, Calogero, Raffaele A, Castrignanò, Tiziana, Pesole, Graziano
Pubblicato in BMC Genomics (2015)

Deptor transcriptionally regulates endoplasmic reticulum homeostasis in multiple myeloma cells

di Catena, Valeria, Bruno, Tiziana, De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Pallocca, Matteo, Iezzi, Simona, Sorino, Cristina, Cigliana, Giovanni, Floridi, Aristide, Blandino, Giovanni, Fanciulli, Maurizio
Pubblicato in Oncotarget (2016)

Combinations of immuno-checkpoint inhibitors predictive biomarkers only marginally improve their individual accuracy

di Pallocca, Matteo, Angeli, Davide, Palombo, Fabio, Sperati, Francesca, Milella, Michele, Goeman, Frauke, De Nicola, Francesca, Fanciulli, Maurizio, Nisticò, Paola, Quintarelli, Concetta, Ciliberto, Gennaro
Pubblicato in J Transl Med (2019)

Multitargeting activity of miR-24 inhibits long-term melatonin anticancer effects

di Mori, Federica, Ferraiuolo, Maria, Santoro, Raffaela, Sacconi, Andrea, Goeman, Frauke, Pallocca, Matteo, Pulito, Claudio, Korita, Etleva, Fanciulli, Maurizio, Muti, Paola, Blandino, Giovanni, Strano, Sabrina
Pubblicato in Oncotarget (2016)

BCL-X(L) overexpression promotes tumor progression-associated properties

di Trisciuoglio, Daniela, Tupone, Maria Grazia, Desideri, Marianna, Di Martile, Marta, Gabellini, Chiara, Buglioni, Simonetta, Pallocca, Matteo, Alessandrini, Gabriele, D’Aguanno, Simona, Del Bufalo, Donatella
Pubblicato in Cell Death Dis (2017)

Poly-specific neoantigen-targeted cancer vaccines delay patient derived tumor growth

di Aurisicchio, Luigi, Salvatori, Erika, Lione, Lucia, Bandini, Silvio, Pallocca, Matteo, Maggio, Roberta, Fanciulli, Maurizio, De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Ciliberto, Gennaro, Conforti, Antonella, Luberto, Laura, Palombo, Fabio
Pubblicato in J Exp Clin Cancer Res (2019)

Hepatitis B protein HBx binds the DLEU2 lncRNA to sustain cccDNA and host cancer-related gene transcription

di Salerno, Debora, Chiodo, Letizia, Alfano, Vincenzo, Floriot, Oceane, Cottone, Grazia, Paturel, Alexia, Pallocca, Matteo, Plissonnier, Marie-Laure, Jeddari, Safaa, Belloni, Laura, Zeisel, Mirjam, Levrero, Massimo, Guerrieri, Francesca
Pubblicato in Gut (2020)

Che-1 sustains hypoxic response of colorectal cancer cells by affecting Hif-1α stabilization

di Bruno, Tiziana, Valerio, Mariacristina, Casadei, Luca, De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Pallocca, Matteo, Catena, Valeria, Iezzi, Simona, Sorino, Cristina, Desantis, Agata, Manetti, Cesare, Blandino, Giovanni, Floridi, Aristide, Fanciulli, Maurizio
Pubblicato in J Exp Clin Cancer Res (2017)

B4GALT1 Is a New Candidate to Maintain the Stemness of Lung Cancer Stem Cells

di De Vitis, Claudia, Corleone, Giacomo, Salvati, Valentina, Ascenzi, Francesca, Pallocca, Matteo, De Nicola, Francesca, Fanciulli, Maurizio, di Martino, Simona, Bruschini, Sara, Napoli, Christian, Ricci, Alberto, Bassi, Massimiliano, Venuta, Federico, Rendina, Erino Angelo, Ciliberto, Gennaro, Mancini, Rita
Pubblicato in J Clin Med (2019)

Che‐1 is targeted by c‐Myc to sustain proliferation in pre‐B‐cell acute lymphoblastic leukemia

di Folgiero, Valentina, Sorino, Cristina, Pallocca, Matteo, De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Bertaina, Valentina, Strocchio, Luisa, Romania, Paolo, Pitisci, Angela, Iezzi, Simona, Catena, Valeria, Bruno, Tiziana, Strimpakos, Georgios, Passananti, Claudio, Mattei, Elisabetta, Blandino, Giovanni, Locatelli, Franco, Fanciulli, Maurizio
Pubblicato in EMBO Rep (2018)

Targeting a phospho-STAT3-miRNAs pathway improves vesicular hepatic steatosis in an in vitro and in vivo model

di Belloni, Laura, Di Cocco, Silvia, Guerrieri, Francesca, Nunn, Abigail D. G., Piconese, Silvia, Salerno, Debora, Testoni, Barbara, Pulito, Claudio, Mori, Federica, Pallocca, Matteo, Sacconi, Andrea, Vivoli, Elisa, Marra, Fabio, Strano, Sabrina, Blandino, Giovanni, Levrero, Massimo, Pediconi, Natalia
Pubblicato in Sci Rep (2018)

Deep sequencing and pathway-focused analysis revealed multigene oncodriver signatures predicting survival outcomes in advanced colorectal cancer

di De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Pallocca, Matteo, Sperati, Francesca, Pizzuti, Laura, Melucci, Elisa, Casini, Beatrice, Amoreo, Carla Azzurra, Gallo, Enzo, Diodoro, Maria Grazia, Buglioni, Simonetta, Mazzotta, Marco, Vici, Patrizia, Sergi, Domenico, Di Lauro, Luigi, Barba, Maddalena, Pescarmona, Edoardo, Ciliberto, Gennaro, De Maria, Ruggero, Fanciulli, Maurizio, Maugeri-Saccà, Marcello
Pubblicato in Oncogenesis (2018)

Coexisting YAP expression and TP53 missense mutations delineates a molecular scenario unexpectedly associated with better survival outcomes in advanced gastric cancer

di Pallocca, Matteo, Goeman, Frauke, De Nicola, Francesca, Melucci, Elisa, Sperati, Francesca, Terrenato, Irene, Pizzuti, Laura, Casini, Beatrice, Gallo, Enzo, Amoreo, Carla Azzurra, Vici, Patrizia, Di Lauro, Luigi, Buglioni, Simonetta, Diodoro, Maria Grazia, Pescarmona, Edoardo, Mazzotta, Marco, Barba, Maddalena, Fanciulli, Maurizio, De Maria, Ruggero, Ciliberto, Gennaro, Maugeri-Saccà, Marcello
Pubblicato in J Transl Med (2018)

The clinical significance of PD-L1 in advanced gastric cancer is dependent on ARID1A mutations and ATM expression

di Buglioni, Simonetta, Melucci, Elisa, Sperati, Francesca, Pallocca, Matteo, Terrenato, Irene, De Nicola, Francesca, Goeman, Frauke, Casini, Beatrice, Amoreo, Carla Azzurra, Gallo, Enzo, Diodoro, Maria Grazia, Pescarmona, Edoardo, Vici, Patrizia, Sergi, Domenico, Pizzuti, Laura, Di Lauro, Luigi, Mazzotta, Marco, Barba, Maddalena, Fanciulli, Maurizio, Vitale, Ilio, De Maria, Ruggero, Ciliberto, Gennaro, Maugeri-Saccà, Marcello
Pubblicato in Oncoimmunology (2018)