Design of Artificial Riboswitches as Biosensors

Bằng Findeiß, Sven, Etzel, Maja, Will, Sebastian, Mörl, Mario, Stadler, Peter F.
Xuất bản năm Sensors (Basel) (2017)

De novo design of a synthetic riboswitch that regulates transcription termination

Bằng Wachsmuth, Manja, Findeiß, Sven, Weissheimer, Nadine, Stadler, Peter F., Mörl, Mario
Được phát hành 2013

RNAblueprint: flexible multiple target nucleic acid sequence design

Bằng Hammer, Stefan, Tschiatschek, Birgit, Flamm, Christoph, Hofacker, Ivo L, Findeiß, Sven
Xuất bản năm Bioinformatics (2017)

Applicability of a computational design approach for synthetic riboswitches

Bằng Domin, Gesine, Findeiß, Sven, Wachsmuth, Manja, Will, Sebastian, Stadler, Peter F., Mörl, Mario
Xuất bản năm Nucleic Acids Res (2017)

Ligand-dependent tRNA processing by a rationally designed RNase P riboswitch

Bằng Ender, Anna, Etzel, Maja, Hammer, Stefan, Findeiß, Sven, Stadler, Peter, Mörl, Mario
Xuất bản năm Nucleic Acids Res (2021)

Bioinformatics of prokaryotic RNAs

Bằng Backofen, Rolf, Amman, Fabian, Costa, Fabrizio, Findeiß, Sven, Richter, Andreas S, Stadler, Peter F
Được phát hành 2014

Proteinortho: Detection of (Co-)orthologs in large-scale analysis

Bằng Lechner, Marcus, Findeiß, Sven, Steiner, Lydia, Marz, Manja, Stadler, Peter F, Prohaska, Sonja J
Được phát hành 2011

TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data

Bằng Amman, Fabian, Wolfinger, Michael T, Lorenz, Ronny, Hofacker, Ivo L, Stadler, Peter F, Findeiß, Sven
Được phát hành 2014

Design criteria for synthetic riboswitches acting on transcription

Bằng Wachsmuth, Manja, Domin, Gesine, Lorenz, Ronny, Serfling, Robert, Findeiß, Sven, Stadler, Peter F, Mörl, Mario
Xuất bản năm RNA Biol (2015)

Beyond Plug and Pray: Context Sensitivity and in silico Design of Artificial Neomycin Riboswitches

Bằng Günzel, Christian, Kühnl, Felix, Arnold, Katharina, Findeiß, Sven, Weinberg, Christina E., Stadler, Peter F., Mörl, Mario
Xuất bản năm RNA Biol (2020)

Computational RNomics of Drosophilids

Bằng Hertel Jana, Reiche Kristin, Washietl Stefan, Hackermüller Jörg, Rose Dominic, Findeiß Sven, Stadler Peter F, Prohaska Sonja J
Được phát hành 2007-11-01

Computational RNomics of Drosophilids

Bằng Rose, Dominic, Hackermüller, Jörg, Washietl, Stefan, Reiche, Kristin, Hertel, Jana, Findeiß, Sven, Stadler, Peter F, Prohaska, Sonja J
Được phát hành 2007

Genome-wide transcriptome analysis of the plant pathogen Xanthomonas identifies sRNAs with putative virulence functions

Bằng Schmidtke, Cornelius, Findeiß, Sven, Sharma, Cynthia M., Kuhfuß, Juliane, Hoffmann, Steve, Vogel, Jörg, Stadler, Peter F., Bonas, Ulla
Được phát hành 2012

Optimization of parameters for coverage of low molecular weight proteins

Bằng Müller, Stephan A., Kohajda, Tibor, Findeiß, Sven, Stadler, Peter F., Washietl, Stefan, Kellis, Manolis, von Bergen, Martin, Kalkhof, Stefan
Được phát hành 2010

Mapping the RNA-Seq trash bin: Unusual transcripts in prokaryotic transcriptome sequencing data

Bằng Doose, Gero, Alexis, Maria, Kirsch, Rebecca, Findeiß, Sven, Langenberger, David, Machné, Rainer, Mörl, Mario, Hoffmann, Steve, Stadler, Peter F.
Được phát hành 2013

RNAcode: Robust discrimination of coding and noncoding regions in comparative sequence data

Bằng Washietl, Stefan, Findeiß, Sven, Müller, Stephan A., Kalkhof, Stefan, von Bergen, Martin, Hofacker, Ivo L., Stadler, Peter F., Goldman, Nick
Được phát hành 2011

Conserved introns reveal novel transcripts in Drosophila melanogaster

Bằng Hiller, Michael, Findeiß, Sven, Lein, Sandro, Marz, Manja, Nickel, Claudia, Rose, Dominic, Schulz, Christine, Backofen, Rolf, Prohaska, Sonja J., Reuter, Gunter, Stadler, Peter F.
Được phát hành 2009