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scBatch: batch-effect correction of RNA-seq data through sample distance matrix adjustment

MOTIVATION: Batch effect is a frequent challenge in deep sequencing data analysis that can lead to misleading conclusions. Existing methods do not correct batch effects satisfactorily, especially with single-cell RNA sequencing (RNA-seq) data. RESULTS: We present scBatch, a numerical algorithm for b...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Main Authors: Fei, Teng, Yu, Tianwei
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7214039/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32053185
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa097
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