تحميل...

Alevin efficiently estimates accurate gene abundances from dscRNA-seq data

We introduce alevin, a fast end-to-end pipeline to process droplet-based single-cell RNA sequencing data, performing cell barcode detection, read mapping, unique molecular identifier (UMI) deduplication, gene count estimation, and cell barcode whitelisting. Alevin’s approach to UMI deduplication con...

وصف كامل

محفوظ في:
التفاصيل البيبلوغرافية
الحاوية / القاعدة:Genome Biol
المؤلفون الرئيسيون: Srivastava, Avi, Malik, Laraib, Smith, Tom, Sudbery, Ian, Patro, Rob
التنسيق: Artigo
اللغة:Inglês
منشور في: BioMed Central 2019
الموضوعات:
الوصول للمادة أونلاين:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6437997/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30917859
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1670-y
الوسوم: إضافة وسم
لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!