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Relative evolutionary rate inference in HyPhy with LEISR

We introduce LEISR (Likehood Estimation of Individual Site Rates, pronounced “laser”), a tool to infer relative evolutionary rates from protein and nucleotide data, implemented in HyPhy. LEISR is based on the popular Rate4Site (Pupko et al., 2002) approach for inferring relative site-wise evolutiona...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:PeerJ
Main Authors: Spielman, Stephanie J., Kosakovsky Pond, Sergei L.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: PeerJ Inc. 2018
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5804317/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29423346
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.7717/peerj.4339
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