Загрузка...

In-depth comparison of somatic point mutation callers based on different tumor next-generation sequencing depth data

Four popular somatic single nucleotide variant (SNV) calling methods (Varscan, SomaticSniper, Strelka and MuTect2) were carefully evaluated on the real whole exome sequencing (WES, depth of ~50X) and ultra-deep targeted sequencing (UDT-Seq, depth of ~370X) data. The four tools returned poor consensu...

Полное описание

Сохранить в:
Библиографические подробности
Опубликовано в: :Sci Rep
Главные авторы: Cai, Lei, Yuan, Wei, Zhang, Zhou, He, Lin, Chou, Kuo-Chen
Формат: Artigo
Язык:Inglês
Опубликовано: Nature Publishing Group 2016
Предметы:
Online-ссылка:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5118795/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27874022
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/srep36540
Метки: Добавить метку
Нет меток, Требуется 1-ая метка записи!