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Improved Model to Predict the Free Energy Contribution of Dinucleotide Bulges to RNA Duplex Stability

Predicting secondary structure of RNA is an intermediate in predicting RNA 3D structure. Commonly, determining RNA secondary structure from sequence uses free energy minimization and nearest neighbor parameters. Current algorithms utilize a sequence independent model to predict free energy contribut...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Biochemistry
Hauptverfasser: Tomcho, Jeremy C., Tillman, Magdalena R., Znosko, Brent M.
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: 2015
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5058784/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26286708
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.5b00474
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