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Fast Search of Thousands of Short-Read Sequencing Experiments

We introduce Sequence Bloom Trees, a method for querying thousands of short-read sequencing experiments by sequence 485 times faster than existing approaches. The approach searches large data archives for all experiments that involve a given sequence. We use Sequence Bloom Trees to search 2652 human...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Nat Biotechnol
Main Authors: Solomon, Brad, Kingsford, Carl
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2016
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4804353/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26854477
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/nbt.3442
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