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Transposon insertion mapping with PIMMS – Pragmatic Insertional Mutation Mapping System

The PIMMS (Pragmatic Insertional Mutation Mapping System) pipeline has been developed for simple conditionally essential genome discovery experiments in bacteria. Capable of using raw sequence data files alongside a FASTA sequence of the reference genome and GFF file, PIMMS will generate a tabulated...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Front Genet
Hauptverfasser: Blanchard, Adam M., Leigh, James A., Egan, Sharon A., Emes, Richard D.
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Frontiers Media S.A. 2015
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4391243/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25914720
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.3389/fgene.2015.00139
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