Bridger: a new framework for de novo transcriptome assembly using RNA-seq data

We present a new de novo transcriptome assembler, Bridger, which takes advantage of techniques employed in Cufflinks to overcome limitations of the existing de novo assemblers. When tested on dog, human, and mouse RNA-seq data, Bridger assembled more full-length reference transcripts while reporting...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Main Authors: Chang, Zheng, Li, Guojun, Liu, Juntao, Zhang, Yu, Ashby, Cody, Liu, Deli, Cramer, Carole L, Huang, Xiuzhen
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2015
Assuntos:
Method
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4342890/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25723335
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0596-2
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