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De novo assembly of bacterial transcriptomes from RNA-seq data

Transcriptome assays are increasingly being performed by high-throughput RNA sequencing (RNA-seq). For organisms whose genomes have not been sequenced and annotated, transcriptomes must be assembled de novo from the RNA-seq data. Here, we present novel algorithms, specific to bacterial gene structur...

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Pubblicato in:Genome Biol
Autore principale: Tjaden, Brian
Natura: Artigo
Lingua:Inglês
Pubblicazione: BioMed Central 2015
Soggetti:
Accesso online:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4316799/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25583448
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-014-0572-2
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