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Extracting the diffusion tensor from molecular dynamics simulation with Milestoning

We propose an algorithm to extract the diffusion tensor from Molecular Dynamics simulations with Milestoning. A Kramers-Moyal expansion of a discrete master equation, which is the Markovian limit of the Milestoning theory, determines the diffusion tensor. To test the algorithm, we analyze overdamped...

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書誌詳細
出版年:J Chem Phys
主要な著者: Mugnai, Mauro L., Elber, Ron
フォーマット: Artigo
言語:Inglês
出版事項: AIP Publishing LLC 2015
主題:
オンライン・アクセス:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4288545/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25573551
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1063/1.4904882
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