These Are Not the K-mers You Are Looking For: Efficient Online K-mer Counting Using a Probabilistic Data Structure

K-mer abundance analysis is widely used for many purposes in nucleotide sequence analysis, including data preprocessing for de novo assembly, repeat detection, and sequencing coverage estimation. We present the khmer software package for fast and memory efficient online counting of k-mers in sequenc...

Mô tả đầy đủ

Đã lưu trong:
Chi tiết về thư mục
Những tác giả chính: Zhang, Qingpeng, Pell, Jason, Canino-Koning, Rosangela, Howe, Adina Chuang, Brown, C. Titus
Định dạng: Artigo
Ngôn ngữ:Inglês
Được phát hành: Public Library of Science 2014
Những chủ đề:
Research Article
Truy cập trực tuyến:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4111482/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25062443
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0101271
Các nhãn: Thêm thẻ
Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự