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Fast computation of a string duplication history under no-breakpoint-reuse

In this paper, we provide an O(n log(2) n log log n log* n) algorithm to compute a duplication history of a string under no-breakpoint-reuse condition. The motivation of this problem stems from computational biology, in particular, from analysis of complex gene clusters. The problem is also related...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Brejová, Broňa, Kravec, Martin, Landau, Gad M., Vinař, Tomáš
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: The Royal Society Publishing 2014
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3996574/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24751867
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1098/rsta.2013.0133
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