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Efficient mapping of Applied Biosystems SOLiD sequence data to a reference genome for functional genomic applications

Summary: Here, we report the development of SOCS (short oligonucleotide color space), a program designed for efficient and flexible mapping of Applied Biosystems SOLiD sequence data onto a reference genome. SOCS performs its mapping within the context of ‘color space’, and it maximizes usable data b...

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ग्रंथसूची विवरण
मुख्य लेखकों: Ondov, Brian D., Varadarajan, Anjana, Passalacqua, Karla D., Bergman, Nicholas H.
स्वरूप: Artigo
भाषा:Inglês
प्रकाशित: Oxford University Press 2008
विषय:
ऑनलाइन पहुंच:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2639273/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18842598
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btn512
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