ALPHLARD: a Bayesian method for analyzing HLA genes from whole genome sequence data

Abstract Background Although human leukocyte antigen (HLA) genotyping based on amplicon, whole exome sequence (WES), and RNA sequence data has been achieved in recent years, accurate genotyping from whole genome sequence (WGS) data remains a challenge due to the low depth. Furthermore, there is no m...

תיאור מלא

שמור ב:
מידע ביבליוגרפי
Main Authors: Shuto Hayashi, Rui Yamaguchi, Shinichi Mizuno, Mitsuhiro Komura, Satoru Miyano, Hidewaki Nakagawa, Seiya Imoto
פורמט: Artigo
שפה:Inglês
יצא לאור: BMC 2018-11-01
סדרה:BMC Genomics
נושאים:
HLA genotyping
Next generation sequencing
Whole genome sequencing
Whole exome sequencing
Cancer immunogenomics
Bayesian hierarchical model
גישה מקוונת:http://link.springer.com/article/10.1186/s12864-018-5169-9
תגים: הוספת תג
אין תגיות, היה/י הראשונ/ה לתייג את הרשומה!

פריטים דומים