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MoCHI: neural networks to fit interpretable models and quantify energies, energetic couplings, epistasis, and allostery from deep mutational scanning data

Abstract We present MoCHI, a tool to fit interpretable models using deep mutational scanning data. MoCHI infers free energy changes, as well as interaction terms (energetic couplings) for specified biophysical models, including from multimodal phenotypic data. When a user-specified model is unavaila...

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Principais autores: Andre J. Faure, Ben Lehner
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2024-12-01
coleção:Genome Biology
Assuntos:
Deep mutational scanning
Neural networks
Thermodynamic models
Epistasis
Allostery
Acesso em linha:https://doi.org/10.1186/s13059-024-03444-y
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