Computationally efficient flux variability analysis

von Gudmundsson, Steinn, Thiele, Ines
Veröffentlicht 2010

Predicting the impact of diet and enzymopathies on human small intestinal epithelial cells

von Sahoo, Swagatika, Thiele, Ines
Veröffentlicht 2013

Anoxic Conditions Promote Species-Specific Mutualism between Gut Microbes In Silico

von Heinken, Almut, Thiele, Ines
Veröffentlicht in Appl Environ Microbiol (2015)

Systematic prediction of health-relevant human-microbial co-metabolism through a computational framework

von Heinken, Almut, Thiele, Ines
Veröffentlicht in Gut Microbes (2015)

Systems biology of host–microbe metabolomics

von Heinken, Almut, Thiele, Ines
Veröffentlicht in Wiley Interdiscip Rev Syst Biol Med (2015)

From Network Analysis to Functional Metabolic Modeling of the Human Gut Microbiota

von Bauer, Eugen, Thiele, Ines
Veröffentlicht in mSystems (2018)

From metagenomic data to personalized in silico microbiotas: predicting dietary supplements for Crohn’s disease

von Bauer, Eugen, Thiele, Ines
Veröffentlicht in NPJ Syst Biol Appl (2018)

Reconstruction annotation jamborees: a community approach to systems biology

von Thiele, Ines, Palsson, Bernhard Ø
Veröffentlicht 2010

von Bertalanffy 1.0: a COBRA toolbox extension to thermodynamically constrain metabolic models

von Fleming, Ronan M. T., Thiele, Ines
Veröffentlicht 2011

A protocol for generating a high-quality genome-scale metabolic reconstruction

von Thiele, Ines, Palsson, Bernhard Ø.
Veröffentlicht 2010

Contextualization Procedure and Modeling of Monocyte Specific TLR Signaling

von Aurich, Maike K., Thiele, Ines
Veröffentlicht 2012

Applying systems biology methods to the study of human physiology in extreme environments

von Edwards, Lindsay M, Thiele, Ines
Veröffentlicht 2013

Systematic genomic analysis reveals the complementary aerobic and anaerobic respiration capacities of the human gut microbiota

von Ravcheev, Dmitry A., Thiele, Ines
Veröffentlicht in Front Microbiol (2014)

Genomic Analysis of the Human Gut Microbiome Suggests Novel Enzymes Involved in Quinone Biosynthesis

von Ravcheev, Dmitry A., Thiele, Ines
Veröffentlicht in Front Microbiol (2016)

Model-based dietary optimization for late-stage, levodopa-treated, Parkinson’s disease patients

von Guebila, Marouen Ben, Thiele, Ines
Veröffentlicht in NPJ Syst Biol Appl (2016)

Comparative Genomic Analysis of the Human Gut Microbiome Reveals a Broad Distribution of Metabolic Pathways for the Degradation of Host-Synthetized Mucin Glycans and Utilization of...

von Ravcheev, Dmitry A., Thiele, Ines
Veröffentlicht in Front Genet (2017)

Predicting gastrointestinal drug effects using contextualized metabolic models

von Ben Guebila, Marouen, Thiele, Ines
Veröffentlicht in PLoS Comput Biol (2019)

Toward systems metabolic engineering in cyanobacteria: Opportunities and bottlenecks

von Nogales, Juan, Gudmundsson, Steinn, Thiele, Ines
Veröffentlicht 2013

Metabolic modelling reveals broad changes in gut microbial metabolism in inflammatory bowel disease patients with dysbiosis

von Heinken, Almut, Hertel, Johannes, Thiele, Ines
Veröffentlicht in NPJ Syst Biol Appl (2021)

Estimation of the number of extreme pathways for metabolic networks

von Yeung, Matthew, Thiele, Ines, Palsson, Bernard Ø
Veröffentlicht 2007