SIS: a program to generate draft genome sequence scaffolds for prokaryotes

Bằng Dias, Zanoni, Dias, Ulisses, Setubal, João C
Được phát hành 2012

REGEN: Ancestral Genome Reconstruction for Bacteria

Bằng Yang, Kuan, Heath, Lenwood S., Setubal, João C.
Được phát hành 2012

Editorial: Computational Methods for Microbiome Analysis

Bằng Setubal, João C., Stoye, Jens, Dutilh, Bas E.
Xuất bản năm Front Genet (2020)

Protein secretion systems in bacterial-host associations, and their description in the Gene Ontology

Bằng Tseng, Tsai-Tien, Tyler, Brett M, Setubal, João C
Được phát hành 2009

Lipoprotein computational prediction in spirochaetal genomes

Bằng Setubal, João C., Reis, Marcelo, Matsunaga, James, Haake, David A.
Được phát hành 2006

MARVEL, a Tool for Prediction of Bacteriophage Sequences in Metagenomic Bins

Bằng Amgarten, Deyvid, Braga, Lucas P. P., da Silva, Aline M., Setubal, João C.
Xuất bản năm Front Genet (2018)

Distribution of nitrogen fixation and nitrogenase-like sequences amongst microbial genomes

Bằng Dos Santos, Patricia C, Fang, Zhong, Mason, Steven W, Setubal, João C, Dixon, Ray
Được phát hành 2012

Genetic resources for advanced biofuel production described with the Gene Ontology

Bằng Torto-Alalibo, Trudy, Purwantini, Endang, Lomax, Jane, Setubal, João C., Mukhopadhyay, Biswarup, Tyler, Brett M.
Được phát hành 2014

Genetic resources for methane production from biomass described with the Gene Ontology

Bằng Purwantini, Endang, Torto-Alalibo, Trudy, Lomax, Jane, Setubal, João C., Tyler, Brett M., Mukhopadhyay, Biswarup
Xuất bản năm Front Microbiol (2014)

Molecular Adaptations of Bacterial Mercuric Reductase to the Hypersaline Kebrit Deep in the Red Sea

Bằng Ramadan, Eman, Maged, Mohamad, El Hosseiny, Ahmed, Chambergo, Felipe S., Setubal, João C., El Dorry, Hamza
Xuất bản năm Appl Environ Microbiol (2019)

Analysis of Schistosoma mansoni genes shared with Deuterostomia and with possible roles in host interactions

Bằng Venancio, Thiago M, DeMarco, Ricardo, Almeida, Giulliana T, Oliveira, Katia C, Setubal, João C, Verjovski-Almeida, Sergio
Được phát hành 2007

Transcriptomes of Ralstonia solanacearum during Root Colonization of Solanum commersonii

Bằng Puigvert, Marina, Guarischi-Sousa, Rodrigo, Zuluaga, Paola, Coll, Núria S., Macho, Alberto P., Setubal, João C., Valls, Marc
Xuất bản năm Front Plant Sci (2017)

Positive selection is the main driving force for evolution of citrus canker-causing Xanthomonas

Bằng Zhang, Yunzeng, Jalan, Neha, Zhou, Xiaofeng, Goss, Erica, Jones, Jeffrey B, Setubal, João C, Deng, Xiaoling, Wang, Nian
Xuất bản năm ISME J (2015)

Complete genome sequence of the potato pathogen Ralstonia solanacearum UY031

Bằng Guarischi-Sousa, Rodrigo, Puigvert, Marina, Coll, Núria S., Siri, María Inés, Pianzzola, María Julia, Valls, Marc, Setubal, João C.
Xuất bản năm Stand Genomic Sci (2016)

Role of Recombination in the Evolution of the Model Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000, a Very Atypical Tomato Strain

Bằng Yan, Shuangchun, Liu, Haijie, Mohr, Toni J., Jenrette, Jenny, Chiodini, Rossella, Zaccardelli, Massimo, Setubal, João C., Vinatzer, Boris A.
Được phát hành 2008

Comparative Genomic Analysis of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1, Which Causes Citrus Bacterial Spot Disease, and Related Strains Provides Insights into Virulence and Host S...

Bằng Jalan, Neha, Aritua, Valente, Kumar, Dibyendu, Yu, Fahong, Jones, Jeffrey B., Graham, James H., Setubal, João C., Wang, Nian
Được phát hành 2011

Sequence verification of synthetic DNA by assembly of sequencing reads

Bằng Wilson, Mandy L., Cai, Yizhi, Hanlon, Regina, Taylor, Samantha, Chevreux, Bastien, Setubal, João C., Tyler, Brett M., Peccoud, Jean
Được phát hành 2013

Impact of phages on soil bacterial communities and nitrogen availability under different assembly scenarios

Bằng Braga, Lucas P. P., Spor, Aymé, Kot, Witold, Breuil, Marie-Christine, Hansen, Lars H., Setubal, João C., Philippot, Laurent
Xuất bản năm Microbiome (2020)

Comparative Analysis of Ralstonia solanacearum Methylomes

Bằng Erill, Ivan, Puigvert, Marina, Legrand, Ludovic, Guarischi-Sousa, Rodrigo, Vandecasteele, Céline, Setubal, João C., Genin, Stephane, Guidot, Alice, Valls, Marc
Xuất bản năm Front Plant Sci (2017)

Characterization of Novel Brucella Strains Originating from Wild Native Rodent Species in North Queensland, Australia

Bằng Tiller, Rebekah V., Gee, Jay E., Frace, Michael A., Taylor, Trevor K., Setubal, Joao C., Hoffmaster, Alex R., De, Barun K.
Được phát hành 2010