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Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

BACKGROUND: De novo RNA-Seq assembly is a powerful method for analysing transcriptomes when the reference genome is not available or poorly annotated. However, due to the short length of Illumina reads it is usually impossible to reconstruct complete sequences of complex genes and alternative isofor...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:BMC Bioinformatics
Main Authors: Prjibelski, Andrey D., Puglia, Giuseppe D., Antipov, Dmitry, Bushmanova, Elena, Giordano, Daniela, Mikheenko, Alla, Vitale, Domenico, Lapidus, Alla
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7379828/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32703149
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s12859-020-03614-2
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