ShallowHRD: detection of homologous recombination deficiency from shallow whole genome sequencing

SUMMARY: We introduce shallowHRD, a software tool to evaluate tumor homologous recombination deficiency (HRD) based on whole genome sequencing (WGS) at low coverage (shallow WGS or sWGS; ∼1X coverage). The tool, based on mining copy number alterations profile, implements a fast and straightforward p...

Mô tả đầy đủ

Đã lưu trong:
Chi tiết về thư mục
Xuất bản năm:Bioinformatics
Những tác giả chính: Eeckhoutte, Alexandre, Houy, Alexandre, Manié, Elodie, Reverdy, Manon, Bièche, Ivan, Marangoni, Elisabetta, Goundiam, Oumou, Vincent-Salomon, Anne, Stoppa-Lyonnet, Dominique, Bidard, François-Clément, Stern, Marc-Henri, Popova, Tatiana
Định dạng: Artigo
Ngôn ngữ:Inglês
Được phát hành: Oxford University Press 2020
Những chủ đề:
Applications Notes
Truy cập trực tuyến:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7320600/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32315385
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa261
Các nhãn: Thêm thẻ
Không có thẻ, Là người đầu tiên thẻ bản ghi này!

Những quyển sách tương tự