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Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia

The pairing of CRISPR/Cas9-based gene editing with massively parallel single-cell readouts now enables large-scale lineage tracing. However, the rapid growth in complexity of data from these assays has outpaced our ability to accurately infer phylogenetic relationships. First, we introduce Cassiopei...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Biol
Hauptverfasser: Jones, Matthew G, Khodaverdian, Alex, Quinn, Jeffrey J, Chan, Michelle M, Hussmann, Jeffrey A, Wang, Robert, Xu, Chenling, Weissman, Jonathan S, Yosef, Nir
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: BioMed Central 2020
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7155257/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32290857
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-020-02000-8
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