Загрузка...

BLAMM: BLAS-based algorithm for finding position weight matrix occurrences in DNA sequences on CPUs and GPUs

BACKGROUND: The identification of all matches of a large set of position weight matrices (PWMs) in long DNA sequences requires significant computational resources for which a number of efficient yet complex algorithms have been proposed. RESULTS: We propose BLAMM, a simple and efficient tool inspire...

Полное описание

Сохранить в:
Библиографические подробности
Опубликовано в: :BMC Bioinformatics
Главный автор: Fostier, Jan
Формат: Artigo
Язык:Inglês
Опубликовано: BioMed Central 2020
Предметы:
Online-ссылка:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7068855/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32164557
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s12859-020-3348-6
Метки: Добавить метку
Нет меток, Требуется 1-ая метка записи!