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Inverse Folding with RNA-As-Graphs Produces a Large Pool of Candidate Sequences with Target Topologies

We present an RNA-As-Graphs (RAG) based inverse folding algorithm, RAG-IF, to design novel RNA sequences that fold onto target tree graph topologies. The algorithm can be used to enhance our recently reported computational design pipeline (Jain et. al, NAR 2018). The RAG approach represents RNA seco...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:J Struct Biol
Main Authors: Jain, Swati, Tao, Yunwen, Schlick, Tamar
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2019
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7042079/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31874236
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2019.107438
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