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Dashing: fast and accurate genomic distances with HyperLogLog

Dashing is a fast and accurate software tool for estimating similarities of genomes or sequencing datasets. It uses the HyperLogLog sketch together with cardinality estimation methods that are specialized for set unions and intersections. Dashing summarizes genomes more rapidly than previous MinHash...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Main Authors: Baker, Daniel N., Langmead, Ben
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2019
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6892282/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31801633
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1875-0
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