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SMURF-seq: efficient copy number profiling on long-read sequencers

We present SMURF-seq, a protocol to efficiently sequence short DNA molecules on a long-read sequencer by randomly ligating them to form long molecules. Applying SMURF-seq using the Oxford Nanopore MinION yields up to 30 fragments per read, providing an average of 6.2 and up to 7.5 million mappable f...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Principais autores: Prabakar, Rishvanth K., Xu, Liya, Hicks, James, Smith, Andrew D.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2019
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6615205/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31287019
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1732-1
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